Лечение дисбактериоза кишечника у взрослых схема: Лечение дисбактериоза у взрослых | Клиника Семейный доктор

Содержание

Линекс® экспертный подход к решению любых ситуаций для восстановления баланса микрофлоры

Москва. 30 июля 2015 г. Компания «Сандоз» расширяет линейку препаратов Линекс® — лидера безрецептурного портфеля компании и пробиотика №1 в России.*

Пробиотики являются одной из наиболее динамично развивающихся категорий на мировом фармацевтическом рынке. Связано это с тем, что характер питания населения развитых стран изменился: в рационе большинства современных горожан преобладают продукты, подвергшиеся рафинированию, термической обработке или замораживанию, генной модификации для улучшения вкусовых качеств и продления срока годности. Поэтому пробиотики – препараты, позволяющие поддерживать в норме состояние микрофлоры и здоровье желудочно-кишечного тракта – все чаще используются как в лечебных, так и в профилактических целях. Мировой рынок производства пробиотиков растет ежегодно на 7%.

По данным Euromonitor, к 2017 году он составит 33,5 млрд евро1.

Линекс® хорошо известен российским врачам и потребителям благодаря высочайшему качеству и широкой линейке препаратов, в которой каждый сможет найти для себя оптимальный вариант пробиотика. В июле 2015 году, помимо всеми любимого Линекс® и Линекс для детей®, линейка пополнилась новинкой — Линекс® Форте. Новинка содержит   комплекс из 2-х наиболее изученных бактерий BB-12 и LA-5 в высокой концентрации,что позволяет принимать от одной капсулы в день. что особенно удобно для проведения курсов лечения.Входящие в состав препарата пробиотические штаммы подавляют рост патогенных бактерий и оказывают благотворное влияние на состав кишечной микробиоты (микрофлоры).

Нормальная микрофлора снижая активность болезнетворных микроорганизмов,  подавляет  патогенные, гнилостные и газообразующие бактерии. Кроме того представители кишечной микробиоты принимают участие в жировом и пигментном обмене, стимулируют иммунную систему, принимают активное участие в переваривании пищи. Микробиоценоз желудочно-кишечного тракта – а это приблизительно 100 триллионов микроорганизмов (от 10

13 до 1014) весом около 1,5 кг у взрослого человека – в значительной степени определяет состояние здоровья человека, являясь, по существу, органом, ответственным за ряд ключевых метаболических процессов в организме1-3. Но существует множество факторов, оказывающих негативное влияние на микробиоту кишечника и приводящих к дисбалансу. Это особенности питания, заболевания органов пищеварения, кишечные инфекции, применение антибактериальных препаратов4. Для коррекции состояния кишечной микробиоты при различных патологических состояниях: дисбиозах, диареях различного происхождения, Clostridium difficile ассоциированных инфекциях и др. – используются препараты-пробиотики.

По словам директора по корпоративным связям компании «Сандоз» Юрия Головатчика, новинка станет значимым подспорьем в лечении ряда болезней:

«В состав пробиотика Линекс® Форте в суточной дозировке входят 2 хорошо изученные бактерии, являющие представителями нормальной микрофлоры кишечника — лакто- и бифидобактерии. Бактерии, содержащиеся в капсулах Линекс® Форте, нормализуют и поддерживают физиологический баланс кишечной микрофлоры во всех отделах  кишечника. Линекс

® Форте показан для профилактики и лечения дисбактериоза кишечника, симптомами которого могут быть диарея, запоры, нарушение пищеварения, тошнота, метеоризм, отрыжка и кожные аллергические реакции».

Д.м.н., профессор, заведующая кафедрой пропедевтики детских болезней Педиатрического факультета Первого Московского государственного медицинского университета (Первого МГМУ) им. И.М. Сеченова, Светлана Ильинична Эрдес отметила: «Кишечник не напрасно называют «вторым мозгом» человека. Наше здоровое состояние во многом зависит от микрофлоры кишечника, основы основ слаженной работы организма. Именно поэтому пробиотики  препараты, дающие возможность поддерживать в норме бактериальный состав кишечника – так важны в жизни современного человека. Погрешности в питании, стресс, прием антибиотиков и множество других факторов могут привести к нарушению состава кишечной микробиоты.

Широкая  линейки Линекс® позволяет  подобрать каждому пациенту подходящий для него робиотик    в любой ситуации нарушения микрофлоры!

 

О компании «Сандоз»

Компания «Сандоз», дженериковое подразделение группы компаний «Новартис», является лидером в отрасли воспроизведенных лекарственных средств и постоянно стремится к повышению уровня доступности высококачественной медицинской помощи для пациентов. «Сандоз» располагает штатом свыше 26 000 сотрудников по всему миру. Компания поставляет широкий спектр доступных по цене лекарственных препаратов пациентам в разных странах мира.

Достигнув объема продаж в 9,6 млрд. долларов США в 2014 г. и обладая портфелем лекарственных средств, состоящим из более чем 1100 химических соединений, компания «Сандоз» занимает лидирующую позицию в мире как в области биоаналогов, так и на рынке противоинфекционных и офтальмологических дженериков, а также дженериков применяемых в трансплантологии. Кроме того, компания «Сандоз» является одним из мировых лидеров на рынке дженериков в таких ключевых терапевтических областях как: инъекционные и дерматологические препараты, препараты для лечения заболеваний дыхательной, центральной нервной, сердечно-сосудистой и пищеварительной систем,  метаболических нарушений и болевых синдромов.

Компания «Сандоз» разрабатывает, производит и продает лекарственные средства, а также фармацевтические и биотехнологические активные субстанции действующих веществ. Около половины портфеля препаратов «Сандоз» состоит из различных категорий лекарственных средств, более сложных в разработке и производстве, чем стандартные дженерики.

Начиная с 2003 года, когда компания консолидировала различные направления производства дженериков под брендом «Сандоз», мы наблюдаем высокий естественный рост бизнеса за счет увеличения продаж. В дополнение к этому, рост обусловлен рядом целевых приобретений, которые компания «Сандоз» осуществила в различных регионах и направлениях бизнеса, в том числе «Гексал» (Германия), «Эбеве Фарма» (Австрия) и «Фуджера Фармасьютикалс» (США).

Компания «Сандоз» представлена в Twitter. Подписывайтесь на новости компании по ссылке http://twitter.com/Sandoz_Global.

 

**По продажам в упаковках по данным ООО “АЙ ЭМ ЭС Хэлс”, январь-декабрь 2014

 

  1. Amann R, Fuchs BM.

    Nat Rev Microbiol 2008; 6:339.

  2. Zhao L. Nature Review. Microbiology, Sept 2013; 11:639-47

  3. O’Hara AM&Shanahan F. Best Practice / Research Clinical Gastroenterology 2014; 28:585-97

  4. Приказ N 231 от 9 июня 2003 г. Об утверждении отраслевого стандарта «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника»

Дисбактериоз кишечника у детей: симптомы, признаки, лечение

Для прочтения нужно: 3 мин.

Появление на свет нового человечка — самая главная страница в жизни каждой женщины. И конечно, маме необходимо быть во всеоружии при обнаружении любых возможных недомоганий у малыша. Зачастую детские слезы вызваны болями в животике, а причиной дискомфорта в кишечнике является дисбиоз.

Чтобы не запутать читателя терминами, отметим, что дисбактериоз представляет собой дисбаланс только бактериальной составной микрофлоры. Дисбиоз же — более широкое понятие, под которым подразумевается нарушение баланса всей микрофлоры: и бактерий, и вирусов, и грибов, и простейших. И во многих случаях врачи под привычным нам термином «дисбактериоз» подразумевают именно дисбиоз.

Причины дисбактериоза (дисбиоза) кишечника у ребенка

Простыми словами, дисбиоз — это состояние микрофлоры, при котором количество полезных микроорганизмов меньше, чем патогенных или условно-патогенных. Давайте разберемся, почему появляется дисбиоз и каким он бывает.

Различают два вида дисбиоза:

  • транзиторный (от нуля до семи дней после рождения). Это нормальное состояние, ведь малыш только знакомится с нашим миром. Микрофлора начинает формироваться буквально после первого прикладывания к груди — в кишечник с молоком попадают питательные вещества, полезные бактерии, гормоны.
  • истинный (с седьмого дня). Малыш растет, растут и крошечные колонии микроорганизмов в его желудочно-кишечном тракте. Теперь мама должна учитывать все аспекты повседневной жизни, влияющие на физиологическое развитие малыша.

Вот ряд факторов, способствующих развитию дисбиоза у ребенка:

  • недоношенность,
  • длительное пребывание малыша отдельно от матери,
  • искусственное вскармливание,
  • прием антибиотиков,
  • инфекционные заболевания,
  • снижение иммунитета по различным причинам.

Конечно, на некоторые из этих факторов мы повлиять никак не можем. Поэтому так важно проводить профилактику дисбиоза. Не стоит менять рацион грудничков без рекомендации педиатра, кормить нужно каждые три-четыре часа, не чаще. Необходимо, чтобы пища была теплой и нежирной. Добавьте в рацион малыша молочнокислые продукты, например кефир. Кроме того, если ребенку выписали антибиотик, можно и даже нужно параллельно давать пробиотики (подробнее об их пользе для здоровья кишечника мы расскажем ниже). Очень велика ценность грудного вскармливания: оно положительно влияет на развитие нормальной микрофлоры кишечника грудничка и на его иммунитет, ведь с грудным молоком в организм ребенка поступают иммуноглобулины IgA, IgМ и IgG, интерферон, а также макрофаги и лимфоциты.

Признаки дисбактериоза (дисбиоза) кишечника у детей: маме на заметку

Дисбактериоз (дисбиоз) кишечника выражается у малышей следующими симптомами:

  • пенистый кал с неприятным кислым запахом,
  • колики,
  • беспокойство и постоянный плач, ребенок подтягивает ножки к животу,
  • обильное срыгивание,
  • рвота,
  • вздутие живота,
  • запоры,
  • диарея,
  • аллергические реакции, дерматит.

Если вы заметили такие симптомы у вашего малыша, важно вовремя обратиться к педиатру. Дисбактериоз (дисбиоз) кишечника у детей до года — это распространенная проблема, которую довольно просто решить при правильном подходе. Однако необходимо исключить вероятность болезней желудочно-кишечного тракта — у них могут быть похожие симптомы.

Меры по устранению дисбактериоза (дисбиоза)

Хоть термин «дисбиоз» и звучит как название болезни, это все-таки не болезнь. И все мероприятия по нормализации микрофлоры — скорее, не лечение, а коррекция, устранение патогенных бактерий из организма и восстановление (или создание) нормальной микрофлоры.

В начале коррекции нужно провести специальное микробиологическое исследование кала. Оно позволит определить количество потенциально-патогенных микроорганизмов. Если их количество превышает допустимый уровень, назначают специальные средства — бактериофаги. Это предшественники антибиотиков, вирусы, выборочно угнетающие рост «вредных» микроорганизмов. Бактериофагами в нашей стране лечили еще до появления антибиотиков, и их лечебная эффективность доказана на практике многих поколений.

Это важно

Давать антибактериальные средства малышу необходимо строго по рекомендации лечащего врача — самостоятельное назначение может только усугубить ситуацию. Впрочем, любое самолечение в принципе недопустимо.

Как еще можно лечить дисбактериоз (дисбиоз) кишечника у ребенка?

  1. Для уменьшения агрессивности содержимого кишечника применяют сорбенты (Энтеросгель®, Смекта®). Это средства, связывающие и выводящие из организма малыша токсины.
  2. Нормализовать моторную функцию кишечника можно с помощью пребиотиков (лактулоза, клетчатка). Эти вещества активизируют содержащиеся в кишечнике полезные бактерии и способствуют оздоровлению микрофлоры.
  3. Для улучшения переваривания пищи назначают ферменты, расщепляющие белки, жиры и углеводы для их полноценного усвоения.
  4. Рациональное и полноценное питание — одно из важнейших условий поддержания здоровья ребенка. При дисбиозе исключают из меню сырые овощи и фрукты, кислые соки. В первые два дня лечения малышам до года дают овощные пюре, каши и слизистые супы, компот и запеченные яблоки. На третий день разрешается добавлять в рацион бульоны из нежирных сортов рыбы и мяса.
  5. Восстановить микрофлору помогает и прием пробиотиков. Это культуры лактобацилл и бифидобактерий, которые участвуют в выработке собственного витамина B5 (пантотеновой кислоты), стимулируют местный иммунитет, выводят токсины, поддерживают пристеночное пищеварение, участвуют в процессе всасывания и усвоения питательных веществ, улучшают перистальтику кишечника и нормализуют процесс эвакуации непереваренных остатков.

Лакто- и бифидобактерии «по умолчанию» содержатся в кишечнике с первых дней жизни. Однако их количественная пропорция в организме малыша варьируется в зависимости от ряда индивидуальных показателей: характера питания, наличия заболеваний, особенностей метаболизма и других. Понять, в каком именно виде полезных микроорганизмов нуждается детский организм, непросто, поэтому оптимален прием комплексного пробиотика, в котором содержатся и бифидо-, и лактобактерии. Такой состав предпочтителен и потому, что лактобациллы синтезируют молочную кислоту, которая обеспечивает благоприятную для полезных бифидобактерий кислую среду.

При выборе пробиотика стоит обратить внимание не только на состав, но и на форму выпуска средства. Для коррекции дисбактериоза (дисбиоза) кишечника у детей до трех лет оптимальная форма — это капли. Как правило, их можно смешивать с теплым молоком или добавлять в пищу, что обеспечивает комфортное применение у малыша. К тому же капли часто оснащают удобным дозатором, позволяющим отмерить необходимое количество средства.

В настоящее время много споров о том, является ли дисбиоз отклонением от нормы и стоит ли его лечить. Тем не менее дисбиоз имеет вполне конкретные причины и симптомы, своевременная корректировка которых крайне важна для растущего детского организма.


Амелёхин Леонид Александрович Ответственный редактор

Дисбактериоз кишечника: лечение и диагностика

Слизистая кишечника — полноценная экосистема, которую населяют десятки видов микроорганизмов. Их видовой состав зависит от возраста человека, региона проживания, рациона и других факторов. Условно бактерии можно разделить на полезные, которые необходимы для полноценной работы ЖКТ, нейтральные и условно-патогенные.

Потенциально опасные микробы могут присутствовать в кишечнике здорового человека в минимальном количестве, не вызывая заболевание. Равновесие между вредными и полезными «обитателями» кишечной среды имеет основополагающее значение для пищеварения и здоровья в целом.

При нарушении баланса микрофлоры возникает дисбактериоз кишечника. «Плохих» микроорганизмов становится больше, чем «хороших», что нарушает усвоение питательных веществ, снижает защитные функции слизистой, способствует развитию серьезных заболеваний.

Симптомы дисбактериоза кишечника

Причиной патологических нарушений кишечной среды может стать лечение антибиотиками или противовоспалительными препаратами, инфекционное заболевание, пищевое отравление, неправильный рацион. Перекос в видовом составе организмов возникает на фоне гельминтозов, болезней ЖКТ. Также в группе риска находятся люди, которые увлекаются слишком жесткими диетами, бесконтрольно принимают энтеросорбенты, слабительные препараты, делают клизмы для очищения кишечника.

Нарушение равновесия кишечной среды можно заподозрить по следующим признакам:

Дисбактериоз кишечника негативно влияет на внешность и самочувствие. Из-за дефицита питательных веществ пациент испытывает слабость и упадок сил, становится более раздражительным. Снижение защитных функций кишечника приводит к тому, что организм не в состоянии справиться с токсинами. Пациенты жалуются на Частые мигрени и головные боли. К кому обратиться? головные боли и другие признаки интоксикации.

Женщины отмечают повышенную ломкость ногтей и ухудшение роста волос, их выпадение. На фоне продолжительного дисбактериоза кишечника может развиваться анемия, вызванная дефицитом витаминов и микроэлементов.Кожа на теле становится сухой, а на лице, наоборот, более жирной. При закупорке пор на лице появляется Что может вызвать сыпь? сыпь.

Симптоматика нарушения кишечной микрофлоры очень обширна и схожа с другими заболеваниями. Для уточнения диагноза необходимо обратиться к гастроэнтерологу и пройти обследование.

Анализ на дисбактериоз

При симптомах дисбактериоза кишечника врач назначает комплекс лабораторных исследований, которые позволяют выявить природу заболевания. В их числе:

  • общеклинические анализы крови и мочи;
  • анализ крови на сахар, электролиты, биохимические показатели;
  • копрограмма;
  • анализ на общий белок;
  • бактериальный посев кала на патогенную микрофлору и гельминтоз.

Как собрать кал на дисбактериоз?

Копрограмма позволяет диагностировать заболевания органов пищеварения. Бакпосев кала проводят для выявления паразитарной или инфекционной природы патологии. Перед дефекацией необходимо опорожнить мочевой пузырь, провести гигиенические процедуры. Дно унитаза застелить бумагой или использовать одноразовую пластиковую тарелку. Кал собирают утром или максимум за 8 часов до сдачи в лабораторию в чистую емкость. 

За 3 дня до сбора кала откажитесь от антибиотиков и слабительных, препаратов железа. За 2 дня — исключите из рациона томаты, свеклу и другие продукты с высоким содержанием красящих пигментов, жирные и острые блюда. Нельзя сдавать анализ во время менструации.

Лечение дисбактериоза кишечника

Первым этапом лечения дисбактериоза кишечника является диетотерапия. Корректировка рациона направлена на ограничение или отказ от продуктов, которые создают благоприятную среду для патогенов, раздражают кишечник и усиливают брожение.

Чем лечить дисбактериоз кишечника определит гастроэнтеролог после комплексной диагностики, которая включает лабораторные исследования,рентгенографию и УЗИ органов брюшной полости. После определения состояния органов ЖКТ, выявления состава микрофлоры пациенту назначаются необходимые препараты. Их действие направлено на лечение заболевания, которое привело к дисбалансу, и нормализацию кишечной среды.

Диета при дисбактериозе

Соблюдение рекомендаций по питанию — обязательное условие успешной терапии дисбактериоза. При составлении рациона откажитесь от следующих продуктов:

  • сладости;
  • жирное мясо, копчености, консервы, острые маринады;
  • дрожжевой хлеб и другие продукты, усиливающие газообразование.

При дисбалансе кишечной среды полезна еда, богатая клетчаткой. В основе рациона должны быть каши, свежие овощи, сухофрукты, нежирное мясо, кисломолочная продукция. Рекомендовано питаться небольшими порциями несколько раз в день, не допуская переедания и голодания. Необходимо выпивать 1,5-2 литра воды в день и ограничить газированные напитки, кофе и алкоголь.

Метеоризм как симптом дисбактериоза

Метеоризмом называют увеличенное скопление газов в кишечнике, вызванное их недостаточным выведением или повышенным газообразованием. Он является основным симптомом дисбактериоза кишечника. При обращении к врачу пациенты жалуются на «разговорчивый» живот, который постоянно урчит, на вздутие, периодические распирающие боли, которые могут усиливаться из-за спазмов кишечника.

Причины метеоризма 

В желудке и ободочной кишке здоровых людей содержится определенный объем газов, но в некоторых случаях наблюдается повышенное газообразование. Причины метеоризма могут быть разными: лечение требуется не всегда. Зачастую пациенту лишь необходимо пересмотреть свой образ жизни.

Если есть второпях, на бегу, происходит заглатывание больших порций воздуха с пищей, что приводит к вздутию кишечника. Аналогичная ситуация возникает у здоровых людей, злоупотребляющих газированными напитками, пивом, квасом, продуктами, которые усиливают процесс брожения, например, черным хлебом, бобовыми, капустой. Лечение метеоризма в этом случае заключается в нормализации рациона.

С чем связан частый метеоризм?

Регулярно возникающий метеоризм — повод насторожиться. Повышенное газообразование, которое напоминает о себе после каждого приема пищи, может являться признаком целого ряда заболеваний. В их числе — дисбактериоз кишечника, ферментативная недостаточность, нарушение образования желчных кислот. Вздутие живота может вызвать механическое препятствие: опухоль или спайка кишки.

У пациентов с заболеваниями печени и желчевыводящих путей метеоризм сопровождается тяжестью в животе, тошнотой, дискомфортом в правом подреберье, общей слабостью.

Метеоризм возникает при инфекционных и воспалительных заболеваниях органов ЖКТ. В их числе — колит, панкреатит, кишечные инфекции. Эти болезни опасны своими осложнениями и требуют обязательного лечения в отделении гастроэнтерологии. 

У людей с непереносимостью лактозы вздутие живота вызывает употребление молочных продуктов. Если повышенное газообразование возникает на фоне патологических процессов в органах ЖКТ, лечение метеоризма направлено на устранение основной причины его появления. Схему терапии определяет врач после проведения диагностики.

Вздутием живота могут страдать и люди со здоровым желудочно-кишечным трактом. Частые стрессы, перевозбуждение приводят к спазму гладкой мускулатуры кишечника. Это ухудшает перистатику, приводит к скоплению газов и вызывает чувство распирания. Для лечения метеоризма, имеющего психогенную природу, нужно нормализовать психоэмоциональное состояние.

Вздутие живота у беременных женщин вызвано увеличением размеров матки, которая сдавливает стенки кишечника. Также гормон прогестерон, вырабатываемый при беременности, вызывает расслабление не только матки, но и мышц кишечника, что приводит к замедлению перистальтики и накоплению газов.

Чем лечить метеоризм в домашних условиях?

Основным способом лечения повышенного газообразования в домашних условиях является диетотерапия. Избегайте бобовых, пива, кваса, сдобы, ограничьте употребление яблок и капусты. Все эти продукты вызывают брожение. Будет полезным включить в рацион рассыпчатые каши, отварные овощи, кисломолочные продукты.

При отсутствии индивидуальной непереносимости можно дополнить домашнюю терапию растительными отварами. От повышенного скопления газов помогают чаи на основе мяты, аптечной ромашки, сушеного имбиря, семян тмина. Маленьким детям можно приготовить укропный чай.

Причиной вздутия живота и увеличенного скопления газов в кишечнике может быть патологический процесс или инфекция. Лечение метеоризма включает прием медикаментов, которые назначает гастроэнтеролог.

Как лечить метеоризм кишечника?

В первую очередь необходимо определить, что является причиной метеоризма. По результатам диагностики определяется схема лечения. Если газообразование вызвано избыточным заглатыванием воздуха, откажитесь от жевательной резинки, газировки, перекусов на ходу. Если виновниками вздутия живота являются продукты, усиливающие брожение, их употребление придется ограничить или исключить.

Для профилактики вздутия здоровым людям рекомендуется избегать слишком горячей или холодной пищи, употребления большого количества кофе, газировки, сладостей, дрожжевых продуктов, снеков. Из овощей и фруктов ограничьте редис, зеленый и репчатый лук, капусту, яблоки. Причиной пучения может стать овес и продукты из него, включая мюсли, быстрые завтраки на основе злаков. У некоторых людей урчание и вздутие живота возникает после употребления жареного мяса, блюд с высоким содержанием жиров.

Лечение от метеоризма при панкреатите включает прием препаратов, которые восполняют нехватку ферментов поджелудочной железы. Если причиной увеличенного скопления газов является опухоль или спайки, назначают хирургическое лечение. Метеоризм на фоне дисбактериоза проходит после восстановления кишечной микрофлоры.

Чем лечить метеоризм при беременности?

Метеоризм у беременных не опасен, но может приводить к спазмированию мышц и вызывать тянущие боли внизу живота. Лечение обычно не требуется, достаточно подкорректировать рацион, исключив из него продукты, вызывающие повышенное газообразование. Принимать пищу рекомендуется часто (5-6 раз в день), но понемногу и не спеша. Помогают от метеоризма отвары ромашки, мяты, некрепкие имбирные и укропные чаи.

Дисбактериоз — это не самостоятельное заболевание, а следствие неправильного питания или нарушения в работе ЖКТ. Успех лечения напрямую зависит от правильной диагностики и следования рекомендациям врача.

Дисбактериоз: причины, симптомы, лечение | «УРО-ПРО» Екатеринбург

Организм человека является сложной и открытой экологической системой, важное место в которой занимает микрофлора. При этом для каждой системы органов состав этой микрофлоры отличается. По оценкам ученых, примерно 60% всех микроорганизмов, которые населяют наш организм, сосредоточены в желудочно-кишечном тракте. Кроме того, микрофлора кишечника отличается выраженным разнообразием и насчитывает около 500 различных видов бактерий. Многочисленность микрофлоры, индивидуальные особенности строения человека, пищевые предпочтения, место проживания и даже способ появления на свет создает уникальный и достаточно динамичный микробный пейзаж в каждом из нас. Первооткрывателями кишечника становятся актинобактерии, заселяющие его во время прохождения плода по родовым путям, а в конце жизни человека сопровождает большое количество фирмикутов.
Если качественное или количественное соотношение привычных кишечнику микроорганизмов изменяется, то говорят о дисбактериозе. Данное состояние не является самостоятельным заболеванием, а расценивается как клинико-лабораторный синдром, который развивается вследствие других патологических факторов. То есть дисбактериоз всегда является вторичным. Тем не менее, он может приводить к развитию неспецифических симптомов.


Разновидности кишечной микрофлоры

Все микроорганизмы, которые населяют желудочно-кишечный тракт, можно разделить на три большие группы:

  • Облигатная микрофлора. Представлена бактериями, которые постоянно присутствуют в ЖКТ и составляют практически 95 % от общей микробной массы кишечника. Поэтому ее еще называют главной или коренной. Облигатная микрофлора выполняет важные функции — препятствует развитию инфекций, стимулирует местный иммунный ответ, способствует синтезу некоторых витаминов и др.
  • Факультативная микрофлора. Микроорганизмы из этой группы достаточно часто выявляются у здоровых людей, однако они не всегда присутствуют в ЖКТ. Наиболее важное значение имеют условно-патогенные бактерии, которые при ослаблении защитных механизмов могут приводить к развитию некоторых заболеваний. В обычном же состоянии данная микрофлора участвует в «тренировке» иммунных клеток и вырабатывает ряд активных веществ.
  • Транзиторная (случайная) микрофлора. Представлена свободно живущими микроорганизмами, которые легко могут проникать в кишечник из окружающей среды и точно также легко покидать его. Как и предыдущий вид, представители транзиторной микрофлоры могут приводить к развитию инфекционных заболеваний у людей со сниженным иммунитетом.

В каждом отделе пищеварительной системы данные группы микрофлоры находятся в определенном соотношении, которое помогает поддерживать их нормальную жизнедеятельность.


Почему развивается дисбактериоз

Главная причина качественных и количественных изменений микрофлоры — нарушение работы пищеварительной системы вследствие различных заболеваний. Это заболевания кишечника различной природы, гельминтоз, инфекция, нарушение моторики и другие. Также это может быть патология печени и желчного пузыря, поджелудочной железы и желудка. Кроме того, известны и другие факторы, которые могут привести к развитию дисбактериоза. К ним относятся:

  • Прием антибактериальных препаратов.
  • Вредные условия труда и неблагоприятная экологическая обстановка.
  • Неправильное питание и диеты.
  • Злоупотребление спиртными напитками и никотиновая зависимость.
  • Путешествия и гастрономический туризм.

Дисбактериоз может развиваться после специфического лечения, например, химиотерапии или лучевой терапии, а также после проведения обширных операций.


Клинические проявления

В первую очередь дисбактериоз проявляется различными нарушениями со стороны пищеварительной системы. Пациенты жалуются на нарушения стула (запор или понос), повышенное газообразование, урчание в животе, боль в животе и др. Среди других симптомов отмечаются:
• Аллергические реакции в виде крапивницы или диатеза (у детей).
• Ухудшение состояния кожи, ногтей, волос за счет недостатка витаминов.
• Общие симптомы – быстрая утомляемость, плохой сон, сниженная работоспособность и др.
Выраженность данных симптомов определяется степенью тяжести дисбактериоза. На начальных этапах клинические проявления минимальны или могут вовсе отсутствовать. По мере прогрессирования первопричины прогрессирует и дисбиоз, увеличивается и интенсивность симптомов, что заставляет пациента обратиться за медицинской помощью.


Методы диагностики и лечения

Врач может заподозрить дисбактериоз при наличии у пациента характерных жалоб, однако для постановки точного диагноза необходимо пройти дополнительное обследование. Как правило, в него включаются микробиологические, серологические, копрологические и другие методики, которые позволяют определить качественный и количественный состав кишечной микрофлоры. После получения объективной информации врач предложит схему лечения.
Для восстановления нормальной микрофлоры назначается комплексное лечение, в которое входят:

  • Правильное питание. В рационе должно содержаться достаточное количество клетчатки и витаминов. Следует ограничить жирную, жареную, острую, копченую пищу, алкоголь, газированные напитки.
  • Восстановление моторики кишечника. С этой целью может назначаться дробное питание (5-6 раз в сутки) или специальные лекарственные препараты (спазмолитики, прокинетики).
  • Снижение агрессивности кишечной среды. Достигается за счет специальной диеты или лекарственных препаратов (сорбенты, антациды).
  • Также для восстановления кишечной микрофлоры могут назначаться пре- и пробиотики. Пребиотики представляют собой различные вещества, которые способствуют размножению «полезных» бактерий. Это могут быть аминокислоты, пептиды, сахара и др. Пробиотики представляют собой препараты, которые содержат живую микрофлору (лактобактерии, бифидобактерии и др. ). Также могут назначаться комбинации данных препаратов, которые называются синбиотики.

Продолжительность лечения зависит от многих факторов, однако при четком соблюдении всех указаний специалиста в подавляющем большинстве случаев удается восстановить нормальную микрофлору кишечника и избавиться от неприятных симптомов дисбактериоза.

Тамбовская областная клиническая больница имени В.Д. Бабенко

Даже оправданное применение антибиотиков при инфекционных заболеваниях  снижает содержание живых микроорганизмов в кишечнике в тысячу — миллион раз! При благоприятных условиях совокупность живых микроорганизмов (микробиота) самостоятельно быстро восстанавливается и это не требует вмешательства. Если же восстановление затягивается, тогда уместно говорить о дисбактериозе.

Следует особо подчеркнуть, что в Международной классификации болезней «дисбактериоз» как самостоятельное заболевание отсутствует, в то же время по данным ВОЗ более 90% жителей Земли в той или иной степени страдают дисбактериозом кишечника.

Если рассматривать проблему комплексно, то  дисбактериоз смело можно причислять к так называемым «болезням цивилизации», обусловленным образом жизни, рафинированным нерациональным питанием современного человека, преобладанием в пище мучного, острого, жирного, отсутствием достаточного количества растительной пищи и кисломолочных продуктов, использованием антибиотиков и других технологических достижений человечества. Из естественных причин, провоцирующих развитие дисбактериоза кишечника, следует упомянуть кишечные инфекции, а также заболевания органов пищеварения —  гастрит, язвенная болезнь, желчнокаменная болезнь и др. Дисбактериоз не развивается у здоровых людей, это маркёр неблагополучия.

Кишечник человека населён целыми полчищами микробов – «плохих», «хороших» и «нейтральных». Полезные микробы — бифидобактерии, лактобактерии и бактероиды  оказывают помощь в пищеварении, защищают от аллергии, поддерживают иммунную систему и даже снижают вероятность развития онкологических заболеваний, держат в узде «врагов»: стафилококков, протея, стрептококков, грибков рода кандида и множество других. Когда баланс нарушается – число «полезных» бактерий снижается,  нарастает количество вредоносных, развивается дисбактериоз. Толчком к его развитию может послужить даже смена привычного рациона питания, что нередко происходит в дальних поездках; существует даже специальный термин – «диарея путешественников». Без лечения в стенке кишки постепенно развиваются воспалительные процессы, болезнь прогрессирует. Длительно текущий дисбактериоз характеризуется нарушением всасывания витаминов, жиров, других компонентов пищи, что приводит к снижению веса, анемии в дальнейшем извращаются иммунные реакции организма, происходит аллергизация.

Восстановление микробиоты процесс сложный и длительный, для этого используют разные методы, одни уничтожают «вредные бактерии», другие добавляют «полезные», третьи помогают собственным микробам восстановиться до нормального состояния. Ни один из них не является абсолютным, но все они  дополняют друг друга и могут использоваться в различном сочетании в зависимости от конкретного случая. Что бы составить представление об этом необходимо выделить основные группы лекарственных препаратов.

Пробиотики содержат живые микробы («pro bios – для жизни», в отличие от антибиотиков,  «anti  bios — против жизни»). Они содержат  один или несколько видов живых бактерий, которые являются  нормальными представителями микрофлоры кишечника: бифидумбактерии, лактобактерии, кишечные палочки, энтерококки. Существуют пробиотики, содержащие свободноживущие во внешней среде виды, например относящиеся к роду Bacillus, безвредные для человека, но губительные для других микробов. Особенностью пробиотических микробов является выраженный антагонизм, то есть способность вытеснять другие виды. Применение пробиоиков оправдано после приёма антибиотиков. Однако в средствах массовой информации часто тиражируется заблуждение, что при приеме антибиотика, что бы защититься от вредного влияния на микробиоту и заселить кишечник «полезными» микробами надо принимать пробиотик. Это в корне неверно, так как микробы, содержащихся в пробиотиках очень чувствительны  к антибиотикам и в первую очередь погибают от них. Кроме того и сами пробиотические бактерии не приживаются в кишечнике, а лишь частично восполняют дефицит собственных микробов. Еще одним недостатком пробиотиков, является необратимый процесс отмирания: количество живых микробов к истечению срока годности препарата многократно ниже, чем при выпуске партии с завода изготовителя. Это надо учитывать при покупке пробиотиков.

Пребиотики. В их составе отсутствуют живые бактерии, но есть вещества, избирательно стимулирующие размножение нормальных видов в составе микрофлоры. Преимущество в том, что они не вступают в конфликт с собственной микрофлорой и не погибают от воздействия антибиотиков. Их нужно принимать совместно с антибиотиками, так как они помогают восстановить собственную микрофлору, а не пытаются заселить кишечник «хорошими», но «чужими» микробами.

Бактериофаги, являющиеся вирусами, уничтожают строго определённые виды бактерий. Каждому виду бактерий соответствует свой бактериофаг. Например, стафилококки разрушаются антистафилококковым бактериофагом, синегнойная палочка — антисинегнойным бактериофагом и т. д. Применение их не всегда эффективно: в агрессивной среде кишечного содержимого бактериофаги могут терять активность, а до бактерий, покрытых слоем кишечной слизи, трудно  добраться.

Распространено мнение, что «вредные бактерии» при дисбактериозе нужно удалять с помощью антибиотиков. Это категорически не приемлемо, так как наносит больше вреда, чем пользы. Применение антибиотиков оправдано только для лечения инфекционного заболевания.

Для дисбактериоза характерно длительное сохранение таких симптомы как вздутие живота, поносы, запоры, запах изо рта, тошнота, аллергические реакции на безобидные продукты. Правильнее всего обратиться к гастроэнтерологу, который направит вас на бактериологический анализ кала, а при необходимости на другие лабораторные и инструментальные исследования. После полноценного обследования будет проведена терапия, направленная на болезнь — причину дисбактериоза и на коррекцию микробиоты.

Микробиологический анализ кала на дисбактериоз поможет врачу в подборе препаратов. Следует помнить, что для получения достоверного результата необходимо придерживаться определенных правил при сборе материала на анализ. Прежде всего за 5-7 дней до сбора материала не принимать препараты, влияющие на результат. За более подробной консультацией необходимо обращаться к специалистам бактериологической лаборатории.

В ГБУЗ «ТОКБ им. В.Д. Бабенко» диагностические исследования проводят квалифицированные специалисты с большим опытом работы в клинической микробиологии, в отделении работают  врачи-бактериологи высшей и первой категории. Наличие современной аппаратуры способствует динамичному развитию лаборатории и поддержанию высокого качества исследований, что помогает установить этиологию микробных заболеваний. Через некоторое время  вы избавитесь от неприятностей со здоровьем и сможете снова радоваться жизни.

19 апреля 2019 года

Дисбактериоз кишечника

Практически все пространство желудочно-кишечного тракта занято десятками видов микроорганизмов (бактерий). Их можно разделить на две большие группы: микроорганизмы, которые приносят человеческому организму только пользу (нормальная флора кишечника) и «недружественные» микроорганизмы (условно-патогенная флора кишечника). При кишечных инфекциях появляются и «вражеские» бактерии; возбудители этих инфекций постоянно живут только у лиц — бактерионосителей. Организм человека, перенесшего инфекцию, настолько привыкает к таким микробам, что они остаются у него жить. При попадании в другой организм они вызывают заболевание — дисбактериоз кишечника.

Дисбактериоз кишечника — изменение нормальной кишечной микрофлоры, включая качественные и количественные ее параметры, а также место ее обитания. Изменение нормального состава микрофлоры кишечника приводит к функциональным нарушениям во всех отделах желудочно-кишечного тракта.

Основные симптомы недостаточности пищеварения:

  • Боли различного характера
  • Расстройство стула с преобладанием поноса
  • Метеоризм. Вздутие живота и урчание усиливается во вторую половину дня и ночью, характерны отрыжка и неприятный привкус во рту
  • Непереносимость определенных пищевых продуктов (чаще всего — молока). После его употребления у больных появляется диарея, испражнения становятся жидкими, объемными, пенистыми. Больных беспокоят вздутие и боль в животе, иногда тошнота и рвота

Для дисбактериоза кишечника характерен дефицит витамина РР, сопровождающийся раздражительностью, неуравновешенностью, подавленностью настроения, конфликтностью, слюнотечением и др. Дефицит витамина В2 проявляется выпадением волос, изменением ногтей, заедами, стоматитом, дерматитом крыльев носа. Для дефицита витаминов B1 и В6 типичны головная боль, слабость, атония кишечника, дистрофические изменения в миокарде, нарушения со стороны периферической нервной системы.

На фоне дисбактериоза нередко развиваются аллергические реакции, которые проявляются либо пищевой идиосинкразией, либо общими аллергическими реакциями (крапивницей, отеком Квинке, бронхоспазмом, полиартралгией, снижением АД). Поражение кишечника характеризуется схваткообразной, реже ноющей тупой болью в животе, урчанием, вздутием и переливанием, а также императивными позывами на опорожнение кишечника. Появляется частый жидкий стул, нередко с примесью непереваренной пищи, реже — крови.

как восстановить микрофлору кишечника ЖКТ после антибиотиков — Семейная Клиника

Открытие антибиотиков стало для медицины настоящей революцией. Более 90 лет они эффективно лечат многие болезни, в основе которых бактериальные инфекции и снимают осложнения буквально за считанные часы. Эффективность настолько высокая, что, даже зная о серьёзных побочных последствиях после их применения, современная медицина от них не отказывается, потому что замены этому виду лекарственных препаратов нет. Сегодня мировой рынок этого вида лекарственных препаратов оценивается в 50 млрд. долларов и продолжает расти быстрыми темпами.

Что такое антибиотики, как они действуют и, каким образом можно восстановить желудочно-кишечный тракт после их применения?

Антибиотики или, как их ещё называют «противомикробные препараты», – это вещества, способные блокировать развитие или вызывать гибель определённых микроорганизмов. Другими словами, это настоящий яд, действие которого направлено на уничтожение бактерий.

Между бактериями и клетками человеческого организма есть сходства и одно принципиальное отличие. Дело в том, что у клеток человека в отличие от бактерий нет клеточной стенки, а антибиотики уничтожают бактерии именно, действуя на стенку и нарушая механизм формирования белка или ДНК, которые у бактерий весьма специфичны. При этом уничтожаются как вредные бактерии, так и полезные, что вызывает дисбактериоз, который если не лечить может затянуть проблемы с желудочно-кишечным трактом на длительное время.

Основные симптомы дисбактериоза:
  • боли в области желудка;
  • тошнота и отрыжка, частая изжога;
  • частицы не переваренной пиши в стуле;
  • сухость кожи, бывают случая появления высыпаний;
  • ломкость и слоение ногтей;
  • сухость волос;
  • потеря веса, снижение иммунитета, ухудшение общего состояния.

Проблемы могут усилиться при наличии стрессов, хронических болезней, включая заболевания ЖКТ, неправильного питания, употребления алкоголя, газированной воды. Вот почему многие пациенты, которые прошли курс лечения этими препаратами, задают вопрос, как восстановить ЖКТ после антибиотиков.

Важно! Появление болей и других симптомов являются сигналом для немедленного обследования и лечения у врача-гастроэнтеролога.Диагностика этого заболевания складывается из анамнеза, жалоб больного, клинической картины, результатов гастроскопии желудка и лабораторных исследований. Главное – вовремя принять меры, которые направлены на восстановление ЖКТ после антибиотиков.

При восстановлении микрофлоры гастроэнтерологи советуют включить в рацион кисломолочные продукты, рыбу и мясо нежирных сортов в запеченном или отварном виде, различные супы-пюре с перетёртыми овощами, компоты, кисели, слизистые каши.

Под запретом:

  • алкоголь;
  • курение;
  • еда всухомятку;
  • жирные мясо и рыба;
  • яйца в варёном и жареном виде;
  • свежий белый хлеб;
  • молоко и свежевыжатые соки;
  • соусы и приправы.

Лечение дисбактериоза врачами гастроэнтерологами Екатеринбурга в медицинском центре «Семейная клиника»

Правильно установленный диагноз и профессионально разработанная тактика лечения являются ключевыми условиями успешного лечения дисбактериоза и быстрого восстановления микрофлоры желудочно-кишечного тракта.

В зависимости от результатов анализов гастроэнтерологи Екатеринбурга нашей клиники могут назначить ряд лекарственных препаратов таких как:

  • пребиотики – препараты, подавляющие патогенную флору, препятствующие её развитию и укрепляющие иммунитет;
  • пробиотики – препараты, содержащие комплекс живых микроорганизмов, способных вести борьбу с вредными бактериями;
  • антисептики – средства, которые уничтожают патогенную флору;
  • бактериофаги – препараты, способные бороться с сальмонеллами, энтерококками, стафилококками.

Внимание! Медикаментозное лечение должно быть назначено только врачом-гастроэнтерологом. Попытки самолечения могут запустить болезнь и ещё больше усложнить проблемы с ЖКТ.

Записаться на приём к гастроэнтерологу в Екатеринбурге можно по телефону +7 (343) 312-81-30 или, заполнив небольшую форму прямо на этом сайте.

Вакцинотерапия от болезней, связанных с дисбактериозом

Авторские права © Автор (ы) 2020. Опубликовано Baishideng Publishing Group Inc. Все права защищены.

Вакцинотерапия при заболеваниях, связанных с дисбактериозом

Косуке Фудзимото, Сатоши Уэмацу

Косуке Фудзимото, Сатоши Уэмацу, Департамент иммунологии и геномики, Высшая школа медицины Городского университета Осаки, Осака 545-8585, Япония

Косуке Фудзимото, Сатоши Уэмацу, Подразделение центра регулирования врожденного иммунитета, Международные исследования и разработки по вакцинам для слизистых оболочек, Институт медицинских наук, Токийский университет, Токио, 113-8654, Япония

Косуке Фудзимото, Сатоши Уэмацу, Отдел метагеномной медицины, Центр генома человека, Институт медицинских наук, Токийский университет , Токио 113-8654, Япония

Сатоши Уэмацу, Коллаборативный научно-исследовательский институт инновационной микробиологии, Токийский университет, Токио 113-8654, Япония

Вклад авторов : Фудзимото К. и Уэмацу С. написали статью.

При поддержке Министерства образования, культуры, спорта, науки и технологий Японии (субсидия для начинающих ученых), № 19K17932 (Фудзимото К.).

Заявление о конфликте интересов : Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

Открытый доступ : Эта статья представляет собой статью с открытым доступом, выбранную штатным редактором и полностью рецензируемую внешними рецензентами. Он распространяется в соответствии с лицензией Creative Commons Attribution NonCommercial (CC BY-NC 4.0) лицензия, которая позволяет другим распространять, ремикшировать, адаптировать, развивать эту работу в некоммерческих целях и лицензировать свои производные работы на других условиях, при условии, что оригинальная работа правильно цитируется и использование не является коммерческим. См .: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Автор, ответственный за переписку : Сатоши Уэмацу, доктор медицинских наук, профессор кафедры иммунологии и геномики Высшей школы медицины Городского университета Осаки, 1- 4-3 Asahi-machi, Abeno-ku, Osaka 545-8585, Япония. [email protected]

Получено: 27 декабря 2019 г.
Началась экспертная оценка : 27 декабря 2019 г.
Первое решение : 14 февраля 2020 г.
Доработано: 27 марта 2020 г.
Принято: 23 мая 2020 г.
Статья в прессе : 23 мая 2020 г.
Опубликована онлайн: 7 июня 2020 г.


ВВЕДЕНИЕ

С быстрым развитием технологий секвенирования и анализа генома нового поколения анализ генома человека закончился, и акцент сместился на исследования комменсальных микробиомов [ 1 8 ] .Участки тела, которые подвергаются воздействию широкого спектра внешних антигенов через участки слизистой оболочки, такие как органы дыхания и желудочно-кишечный тракт, постоянно колонизируются микроорганизмами, что приводит к симбиотическим отношениям. Если эта связь нарушена, иммунный ответ хозяина на микроорганизмы искажается, что иногда вызывает заболевание. Дисбиоз, который определяется как дисбаланс в репертуаре кишечной микробиоты, связан со многими расстройствами у людей [ 9 11 ] .Следовательно, необходимы новые стратегии борьбы с заболеваниями, связанными с дисбактериозом, путем ослабления функции родственных микроорганизмов.

Антибиотики, которые были впервые применены в 1910 году, коренным образом изменили нашу жизнь [ 12 ] . В частности, пенициллин, открытый в 1928 году, способствовал открытию природных антибиотиков. Антибиотики продлили нашу жизнь более чем на 20 лет. Однако быстрое увеличение числа бактерий с множественной лекарственной устойчивостью произошло из-за чрезмерного использования и ненадлежащего потребления и применения антибиотиков, что показывает, что антибиотики не являются панацеей от инфекционных заболеваний [ 13 , 14 ] .Кроме того, антибиотики иногда вызывают дисбактериоз и могут привести к таким заболеваниям, как инфекция Clostridioides difficile ( C. difficile ) [ 15 ] . Таким образом, несмотря на то, что существуют антибиотики для уничтожения комменсальных бактерий, вызывающих заболевание, они не подходят для уничтожения только патогенов.

Трансплантация фекальной микробиоты (FMT), эффективная терапия заболеваний, связанных с дисбактериозом, таких как инфекция C. difficile , улучшает аберрантную кишечную микробиоту. [ 16 , 17 ] .Фекалии здоровых людей, которые считаются относительно безопасными, обычно используются для FMT. Однако недавно сообщалось, что устойчивые к антибиотикам бактерии из донорских фекалий передавались реципиентам и вызывали бактериемию [ 18 ] . Это неотложная проблема, и сейчас FMT не является рекомендуемой схемой. Фактически, удаление только патобионтов через слизистую оболочку кишечника затруднено; поэтому крайне желательна разработка новых методов борьбы с заболеваниями, связанными с дисбактериозом, путем ослабления функции патобионтов.

В этом обзоре мы представляем текущие знания о кишечном микробиоме при здоровье и болезнях, а также обсуждаем вакцину нового поколения для слизистых оболочек типа «прайм-буст», которую мы недавно разработали и сообщили для борьбы с болезнями, опосредованными кишечными бактериями.

КИШЕЧНЫЙ МИКРОБИОМ В ЗДОРОВЬЕ И ЗАБОЛЕВАНИЯХ

Кишечные комменсальные микробы в первую очередь анализировались путем выделения отдельных видов бактерий. Поскольку большинство кишечных бактерий не любят аэробные условия, их было трудно культивировать.Однако достижения в культурально-независимых технологиях, таких как секвенирование следующего поколения, показали динамику микробиоты кишечника человека [ 9 , 19 ] . Например, триллионы кишечных микробов обитают в желудочно-кишечном тракте, а дисбактериоз коррелирует с такими заболеваниями, как ожирение [ 20 22 ] , диабет [ 23 25 ] , ревматоидный артрит (РА) [ 26 31 ] и воспалительные заболевания кишечника (ВЗК), включая болезнь Крона и язвенный колит [ 32 ] . Таким образом, в дополнение к лучшему в настоящее время лечению, предполагается, что контроль дисбактериоза может улучшить эти заболевания.

Широко признано, что метаболические заболевания, такие как ожирение и диабет, тесно связаны с диетой и дисбактериозом [ 22 , 33 ] . У мышей без микробов (GF) не развивается ожирение, вызванное западной диетой [ 34 36 ] . В 2006 году также было показано, что колонизация мышей GF кишечной микробиотой от мышей с ожирением приводила к значительно большему увеличению общего телесного жира, чем колонизация микробиотой от тощих мышей [ 21 ] .Это предполагает тесную связь между кишечной микробиотой и метаболизмом хозяина. Кишечный микробиом мышей и людей с ожирением имеет значительно более высокое соотношение Firmicutes и Bacteroidetes (соотношение F / B), чем у их худых собратьев [ 21 , 37 40 ] . Кроме того, бактериальное разнообразие у тучных людей ниже, чем у худых людей. [ 39 , 41 ] .Однако другие исследования не показали никакой разницы в соотношении F / B между тучными и худыми людьми. [ 42 46 ] . Таким образом, хотя разнообразие людей с ожирением невелико по сравнению с таковым у худощавых людей, корреляция между ожирением и соотношением F / B неясна.

Существует повышенный риск развития диабета 2 типа при ожирении; следовательно, дисбактериоз также может влиять на диабет 2 типа. Предыдущие отчеты показали, что нарушение кишечного углеводного обмена и воспаление кишечника низкой степени вызывают инсулинорезистентность [ 47 49 ] .Уменьшение количества короткоцепочечных жирных кислот, таких как бутират, связано с диабетом 2 типа. [ 50 ] . Vrieze et al. [ 51 ] показали, что FMT улучшает инсулинорезистентность у людей с метаболическим синдромом за счет изменения уровней кишечных бактерий, продуцирующих бутират, что указывает на то, что кишечные микроорганизмы могут быть разработаны в качестве терапевтических инструментов в будущем.

РА — системное воспалительное заболевание, в том числе полиартрит, которое приводит к разрушению суставов.Хотя в патогенезе РА участвуют как генетические факторы, так и факторы окружающей среды, в последнее время большое внимание уделяется анализу кишечной микробиоты, наряду с анализом полиморфизма одиночных нуклеотидов. Когда мышей выращивают в условиях GF, артрит не развивается, что указывает на то, что кишечная микробиота связана с началом артрита [ 28 , 52 54 ] . Abdollahi-Roodsaz et al. [ 53 ] показали, что у мышей с нокаутом антагониста рецептора интерлейкина-1 не развивается спонтанно опосредованный Т-клетками артрит в условиях GF. Однако у них действительно развивается артрит в условиях, свободных от специфических патогенов, и моноколонизация мышей с помощью Lactobacillus bifidus вызывает артрит [ 53 ] . Мацумото и др. [ 55 ] также показали, что у трансгенных мышей с K / BxN Т-клеточным рецептором развивается артрит в условиях отсутствия специфических патогенов, но не в условиях GF, и моноколонизация мышей с помощью сегментированных нитчатых бактерий. вызывает артрит.Предыдущие исследования показали, что состав микробиоты изменяется в раннем RA [ 26 , 28 , 56 ] . На доклинических стадиях РА в кишечнике преобладают видов Prevotella , такие как Prevotella copri ( P. copri ). Maeda et al [ 28 ] показали, что микробиота, выделенная от пациентов с РА, чьи фекальные бактерии содержали высокие уровни P. copri способствует развитию Th27-зависимого артрита, и моноколонизации мышей SKG с помощью P. copri достаточно для индукции артрита. Таким образом, хотя необходимы более точные исследования, чтобы определить, какая бактерия является мишенью для лечения РА, настоятельно рекомендуется наличие кишечных патогенов, которые связаны с патогенезом РА у человека.

Заболеваемость ВЗК во всем мире растет [ 57 ] . Также в Японии число пациентов с ВЗК быстро увеличилось за последние 30 лет, что позволяет предположить, что помимо генетической предрасположенности в развитии ВЗК более активно участвуют факторы окружающей среды, такие как дисбактериоз. [ 58 ] .Сообщалось о различных изменениях кишечной микробиоты у пациентов с ВЗК [ 59 61 ] . Появление секвенирования следующего поколения выявило ряд измененной микробиоты в кишечнике. Однако общая проблема заключается в том, что неясно, является ли дисбактериоз, наблюдаемый у пациентов с ВЗК, причиной или следствием воспаления кишечника. Учитывая сложные взаимоотношения между иммунной системой кишечника и микробиотой кишечника, необходимы дальнейшие исследования для выяснения патогенеза ВЗК и разработки более эффективных методов лечения.

ПРЕМЬЕР-БУСТ-ТИП МУКОЗНАЯ ВАКЦИНА

Обычные инъекционные вакцины, включая подкожные вакцины, обладают способностью индуцировать антиген-специфический IgG, поддерживать антиген-специфическую иммунную память и способствовать предотвращению тяжелой инфекции [ 62 64 ] . Детская вакцинация — ключевой фактор защиты от многих опасных для жизни инфекций [ 64 ] . Однако, несмотря на прогресс в технологии вакцин, во всем мире многие инфекции остаются не полностью контролируемыми как у людей, так и у животных.

Иммунные ответы слизистой оболочки считаются эффективными для предотвращения инфекции, поскольку чужеродные антигены, такие как микроорганизмы и пищевые антигены, проникают в хозяина через поверхности слизистой оболочки [ 65 69 ] . В участках слизистой оболочки секреторный IgA (SIgA) играет важную роль в регулировании здоровья кишечника и профилактике заболеваний [ 70 78 ] . Основными функциями IgA являются (1) предотвращение прикрепления, колонизации и инвазии патогенных микроорганизмов, которые проникают на поверхность слизистой оболочки; (2) нейтрализующее действие на токсины и ферменты, вырабатываемые патогенными микроорганизмами; (3) захват патогенных микроорганизмов в слое слизи; и (4) антимикробная активность.На сегодняшний день доступно лишь ограниченное количество вакцин для слизистых оболочек; поэтому для индукции полезных системных иммунных ответов настоятельно необходима новая стратегия вакцинации слизистых оболочек.

IgA — антитела, наиболее часто встречающиеся в секреторных компонентах слизистой оболочки. В слизистой оболочке кишечника существует два типа механизмов продукции IgA, представленных Т-клеточно-зависимыми и Т-клеточно-независимыми иммунными ответами [ 79 82 ] . В кишечнике Т-клеточно-зависимые ответы антител участвуют в активации В-клеток антигеном в организованной лимфоидной ткани пейеровских бляшек, мезентериальных лимфатических узлов и изолированных лимфоидных фолликулов [ 82 84 ] .Было показано, что как CD40L, так и трансформирующий фактор роста-β1 важны для индукции Т-клеточно-зависимого переключения классов IgA [ 85 ] . Напротив, независимая от Т-клеток рекомбинация переключения класса IgA происходит в клетках B1 кишечной лимфоидной ткани (GALT), где IgA конститутивно индуцируется стимуляцией комменсальными бактериями [ 82 ] .

GALT, такой как пятна Пейера и изолированные лимфоидные фолликулы, является первичным местом индукции IgA. [ 86 , 87 ] .Сообщалось, что антиген-специфические IgA-продуцирующие В-клетки развиваются в GALT с помощью GALT-дендритных клеток (DC). Примечательно, что ретиноевая кислота, синтезируемая GALT-DC, может вносить вклад в синтез IgA. [ 87 89 ] . GALT-DC также способны отпечатывать хемокиновые рецепторы кишечника, такие как интегрин α4β7 и хемокиновый рецептор C-C типа 9, на B- и T-клетках, что является важным процессом для миграции лимфоцитов в кишечник [ 90 ] .

DCs собственной пластинки кишечника (LPDC) также являются важными индукторами SIgA-продуцирующих В-клеток независимым от Т-клеток образом. Ранее мы сообщали о двух подгруппах LPDC тонкого кишечника на основе их дифференциальных паттернов экспрессии CD11c и CD11b: CD11c hi CD11b lo LPDC и CD11c hi CD11b hi LPDC [ 91 ] 93, , ] (Фиг.1). CD11c hi CD11b hi кишечные LPDC экспрессируют ген, кодирующий фермент, превращающий ретиноевую кислоту, Raldh3 , и способны индуцировать антигенспецифический SIgA, а также системный иммунитет, опосредованный Toll-подобным рецептором (TLR) 5 или 9 стимуляция [ 91 ] (Рисунок 1). В отличие от CD11c hi CD11b hi LPDC, CD11c hi CD11b lo LPDC экспрессируют TLR3, TLR7 и TLR9, которые распознают дцРНК, оцРНК и олигодезоксинуклеотиды CpG (ODN) соответственно ] (Рисунок 1). Они не экспрессируют Raldh3 и не участвуют в синтезе IgA в собственной пластинке тонкой кишки [ 93 ] . Кроме того, высокие титры антигенспецифического IgA были обнаружены в экстрактах фекалий нагруженных антигеном CD11c hi CD11b hi LPDC-иммунизированных мышей [ 93 ] .Соответственно, CD11c hi CD11b hi LPDC считаются идеальной мишенью для вакцины для слизистых оболочек, но до сих пор было технически сложно вызвать антиген-специфический иммунитет слизистой оболочки с использованием обычных инъекционных вакцин.

Рис. 1 Функция двух различных дендритных клеток собственной пластинки тонкой кишки. Дендритные клетки собственной пластинки тонкой кишки (LPDC) мышей делят на две подгруппы на основе экспрессии CD11c и CD11b.CD11c hi CD11b lo LPDC экспрессируют Toll-подобный рецептор (TLR) 3, TLR7 и TLR9, тогда как CD11c hi CD11b hi LPDC экспрессируют TLR5 и TLR9. После стимуляции TLR активированные CD11c hi CD11b hi LPDC могут продуцировать интерлейкин (IL) -12p40, IL-6, трансформирующий фактор роста β и ретиноевую кислоту, а затем индуцировать антиген-специфические ответы Th2 и Th27 и антиген-специфические -IgA-продуцирующие плазматические клетки. В отличие от LPDC CD11c hi CD11b hi , активированные LPDC CD11c hi CD11b lo могут индуцировать антиген-специфические ответы Th2, но не антиген-специфические ответы Th27 и антиген-специфические-продуцирующие IgA плазматические клетки. TLR: Toll-подобный рецептор; TGF: трансформирующий фактор роста; IL: интерлейкин; DC: дендритная клетка.

Недавно мы сообщили, что селезеночные ДК, стимулированные курдланом, лигандом дектина-1, и лигандом CpG-ODN, TLR9, успешно индуцировали антиген-специфические фекальные IgA, а также антигенспецифические сывороточные IgG и ответы Th2 и Th27 в селезенке у мышей. [ 94 ] . Это указывает на то, что комбинация курдлана и CpG-ODN доступна в качестве адъюванта парентеральной вакцинации для индукции широкого функционального иммунитета против антигенов слизистой оболочки.Мы обнаружили, что внутримышечная иммунизация комбинацией курдлана и CpG-ODN, эмульгированного с неполным адъювантом Фрейнда, индуцировала антиген-специфические фекальные IgA, а также сывороточные IgG и ответы Th2 и Th27 селезенки [ 94 ] (рис. 2). Однако, хотя антиген-специфический IgG в сыворотке постоянно обнаруживался после первичной инъекции, продукция антиген-специфического IgA в фекалиях была только временно обнаружена парентеральной иммунизацией курдланом + CpG-ODN [ 94 ] . Поэтому считается, что необходима дополнительная иммунизация, например, бустерная, для индукции более стойкого иммунитета слизистой оболочки на целевых участках слизистой оболочки. Мы продемонстрировали, что после перорального, назального или вагинального введения антигена индуцируются высокие титры длительного антиген-специфического кишечного, легочного или вагинального IgA [ 94 ] (рис. 2). Кроме того, эта прайм-буст-вакцина эффективна против диареи, вызванной холерным токсином, и Streptococcus pneumoniae ( S.pneumoniae ) инфекция [ 94 ] . Таким образом, мы создали внутримышечную инъекцию антигена с адъювантом курдлан + CpG-ODN и последующее введение антигена на участки слизистой оболочки (первичная вакцинация) в качестве новой стратегии вакцины, способной вызывать сильный и стойкий системный и слизистый иммунитет.

Рисунок 2 Схема антигенспецифических иммунных ответов при первичной буст-вакцинации. Парентеральная иммунизация антигеном, эмульгированным в курдлане и CpG-олигодезоксинуклеотидах, индуцирует антиген-специфические фекальные IgA, а также сывороточные IgG и ответы Th2 и Th27 в селезенке. После праймирования высокие титры длительного антиген-специфического легочного, кишечного или вагинального IgA индуцируются после назального, перорального или вагинального введения антигена соответственно. Кроме того, в органах-мишенях индуцируются антиген-специфические ответы Th2 и Th27. CpG-ODN: олигодезоксинуклеотиды CpG.

БУДУЩЕЕ РЕГУЛИРОВАНИЕ ЗАБОЛЕВАНИЙ, СВЯЗАННЫХ С ДИСБИОЗОМ

Дисфункция кишечника коррелировала с многофакторными заболеваниями [ 9 ] , что позволяет предположить, что иммунные реакции слизистой оболочки обеспечивают прочную причинную связь между патологическими симптомами в организме хозяина и дисбиозом, связанным с заболеванием. . Несколько исследований идентифицировали некоторых патобионтов, таких как Clostridium ramosum ( C. ramosum ) [ 95 ] , P.copri [ 26 , 28 ] , Helicobacter pylori [ 96 ] , адгезивный инвазивный Escherichia coli [ 97 ] 900stridium, scindens [ 98 ] и Enterococcus gallinarum [ 99 ] . Следовательно, регулирование функции патобионтов, связанных с заболеванием, может привести к профилактике или лечению нарушений, связанных с дисбактериозом.Однако антибиотики не подходят для уничтожения только патогенов, поскольку они могут вызывать дисбактериоз или бактерии с множественной лекарственной устойчивостью [ 100 ] .

C. ramosum — облигатная анаэробная бактерия, впервые обнаруженная у пациента с аппендицитом в 1898 году и широко населяющая желудочно-кишечный тракт человека. Повышенные уровни C. ramosum связаны с ожирением и диабетом человека [ 20 , 23 ] . C. ramosum также связан с клиническими симптомами метаболических нарушений у мышей-гнотобиотов, колонизированных только C. ramosum и упрощенным микробиомом кишечника человека, содержащим C. ramosum . Кроме того, было показано, что количество C. ramosum выше у мышей, получавших пищу с высоким содержанием жиров по сравнению с диетой с нормальным содержанием жиров, и это приводит к повышенной экспрессии Slc2a2 в слизистой оболочке тонкой кишки [ 95, , ] .Поэтому недавно мы применили нашу первичную вакцинацию для борьбы с болезнями, опосредованными C. ramosum . Наша вакцина против C. ramosum значительно ингибировала набор массы тела и повышенные уровни C. ramosum в слизистой оболочке кишечника при диете с высоким содержанием жиров [ 94 ] . Это также привело к снижению экспрессии Slc2a2 и впоследствии к уменьшению непереносимости глюкозы [ 94 ] .Примечательно, что эта стратегия иммунизации не вызывала дисбактериоз [ 94 ] . Таким образом, он может быть эффективным для предотвращения ожирения и диабета, ассоциированного с C. ramosum .

До сих пор существовало несколько методов, которые могут индуцировать высокие титры антиген-специфического IgA на участках слизистой оболочки-мишени с использованием слизистой вакцины инъекционного типа. Примечательно, что мы разработали первичную вакцину для слизистых оболочек нового поколения с использованием курдлана и CpG-ODN и использовали ее для борьбы с такими заболеваниями, как S.pneumoniae и другие заболевания, опосредованные кишечными бактериями [ 94 ] . С появлением гнотобиотических технологий функция кишечного микробиома была раскрыта. Однако, поскольку существует несколько методов специфического ослабления функции кишечных бактерий, многие заболевания, опосредованные кишечными бактериями, до сих пор полностью не выяснены. Наша вакцинация — это первая в мире стратегия иммунизации, которая потенциально может стать отличным методом функционального анализа кишечных бактерий.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

По мере того, как становится очевидной связь между различными заболеваниями и аберрантной кишечной микробиотой, возникает острая необходимость в разработке и распространении стратегий борьбы с дисбактериозом в дополнение к существующим эффективным методам лечения. Антибиотики неспецифичны для патобионтов и могут вызывать дисбактериоз, который может привести к заболеванию. Также были предприняты попытки контролировать заболевания, опосредованные кишечными бактериями, с помощью FMT или пробиотических препаратов, но это уже устоявшиеся и эффективные методы лечения.Важным методом лечения заболеваний, опосредованных кишечными бактериями, является улучшение основного заболевания, не вызывая нового дисбактериоза. Вакцинация курдланом + CpG-ODN и антигенами и последующее введение антигена могут эффективно индуцировать антигенспецифический системный иммунитет и иммунитет слизистых оболочек. Этот метод первичной буст-вакцины был запатентован в Японии, и в настоящее время разрабатываются первичные буст-вакцины против различных инфекционных заболеваний, которые будут отпускаться по рецепту человека. Нет сомнений в том, что технология вакцины, обсуждаемая в этом обзоре, станет новым методом лечения в следующем поколении противомикробных стратегий.Необходим дальнейший анализ микробиоты кишечника, но мы с нетерпением ждем возможности разработки специфических для патобионтов методов лечения заболеваний человека в будущем.

БЛАГОДАРНОСТИ

Мы благодарим К. Огава, М. Маэда и К. Суэцугу за секретарскую помощь.

Источник рукописи: Приглашенная рукопись

Тип специальности: Гастроэнтерология и гепатология

Страна / территория происхождения: Япония

Классификация научного качества отчета экспертной оценки

Оценка A (отлично): 0

Оценка B (очень хорошо): 0

Оценка C (хорошо): C

Оценка D (удовлетворительная): 0

Оценка E (плохая): 0

P-рецензент: Abushady EAE S-редактор: Wang JL L-редактор: E-Editor : Ma YJ

Открытый пилотный проект лечения дисбактериоза кишечника при миалгическом энцефаломиелите / синдроме хронической усталости: нейропсихологические симптомы и сравнение полов | Журнал трансляционной медицины

  • org/ScholarlyArticle»> 1.

    Каррутерс Б.М., ван де Санде М.И., Де Мейрлейр К.Л., Климас Н.Г., Бродерик Г., Митчелл Т. и др. Миалгический энцефаломиелит: критерии международного консенсуса. J Intern Med. 2011; 270: 327–38.

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый

  • 2.

    Джейсон Л.А., Браун А., Клайн Э., Бартгис Л., Эванс М., Браун М. Определения контрастных случаев синдрома хронической усталости, миалгического энцефаломиелита / синдрома хронической усталости и миалгического энцефаломиелита.Eval Health Prof. 2012; 35: 280–304.

    Артикул PubMed Google ученый

  • 3.

    Джейсон Л.А., Эванс М., Браун А., Саннквист М., Ньютон Дж. Л.. Синдром хронической усталости в сравнении с внезапным миалгическим энцефаломиелитом. J Пред. Интерв. Сообщество. 2015; 43: 62–77.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 4.

    Clayton EW. Помимо миалгического энцефаломиелита / синдрома хронической усталости: отчет МОМ о новом определении болезни.JAMA. 2015; 313: 1101–2.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 5.

    Бухвальд Д., Умали П., Умали Дж., Кит П., Перлман Т., Комаров А.Л. Хроническая усталость и синдром хронической усталости: распространенность в системе здравоохранения северо-запада Тихого океана. Ann Intern Med. 1995; 123: 81–8.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • org/ScholarlyArticle»> 6.

    Стил Л., Доббинс Дж. Г., Фукуда К., Рейес М., Рэндалл Б., Коппельман М. и др.Эпидемиология хронической усталости в Сан-Франциско. Am J Med. 1998; 105: 83С – 90С.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 7.

    Рейес М., Нисенбаум Р., Хоаглин Д.К., Унгер Э.Р., Эммонс С., Рэндалл Б. и др. Распространенность и частота синдрома хронической усталости в Уичито, штат Канзас. Arch Intern Med. 2003. 163: 1530–6.

    Артикул PubMed Google ученый

  • 8.

    Ривз У.С., Джонс Дж. Ф., Мэлони Э., Хейм С., Хоаглин Д. К., Бонева Р. С. и др. Распространенность синдрома хронической усталости в столичной, городской и сельской Грузии. Popul Health Metr. 2007; 5: 5.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • org/ScholarlyArticle»> 9.

    Лори С.М., Мандерс Д.Н., Геддес Дж. Р., Пелоси А.Дж.. Популяционное исследование заболеваемости хронической усталостью. Psychol Med. 1997. 27: 343–53.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 10.

    Nacul LC, Lacerda EM, Pheby D, Campion P, Molokhia M, Fayyaz S и др. Распространенность миалгического энцефаломиелита / синдрома хронической усталости (ME / CFS) в трех регионах Англии: повторное поперечное исследование в первичной медико-санитарной помощи. BMC Med. 2011; 9: 91–102.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 11.

    Fuhrer R, Wesseley S. Эпидемиология усталости и депрессии: французское исследование первичной медико-санитарной помощи. Psychol Med.1995; 25: 895–904.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 12.

    Джейсон Л., Браун М., Эванс М., Андерсон В., Лерх А., Браун А. и др. Измерение значительного снижения функциональности у пациентов с синдромом хронической усталости. Disabil Rehabil. 2011; 33: 589–98.

    Артикул PubMed Google ученый

  • 13.

    Андерсон В.Р., Джейсон Л.А., Главати Л.Е., Портер Н., Кудиа Дж.Обзор и мета-синтез качественных исследований миалгического энцефаломиелита / синдрома хронической усталости. Советы по обучению пациентов. 2012; 86: 147–55.

    Артикул PubMed Google ученый

  • org/ScholarlyArticle»> 14.

    Маршалл Р., Пол Л., Вуд Л. Поиск обезболивающих у людей с синдромом хронической усталости: описательное исследование. Physiother Theory Pract. 2011; 27: 373–83.

    Артикул PubMed Google ученый

  • 15.

    Посуда NC. Социосоматика и болезни при синдроме хронической усталости. Psychosom Med. 1998. 60: 394–401.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 16.

    Джейсон Л.А., Бентон М.С., Валентин Л., Джонсон А., Торрес-Хардинг С. Экономическое влияние ME / CFS: индивидуальные и социальные издержки. Dyn Med. 2008; 7: 6.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • org/Book»> 17.

    Фридберг Ф., Джейсон Л. Понимание синдрома хронической усталости: эмпирическое руководство по оценке и лечению. Вашингтон, округ Колумбия: Американская психологическая ассоциация; 1998.

    Google ученый

  • 18.

    Аарон Л.А., Берк М.М., Бухвальд Д. Пересекающиеся состояния у пациентов с синдромом хронической усталости, фибромиалгией и височно-нижнечелюстным расстройством. Arch Intern Med. 2000; 160: 221–7.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 19.

    Chia JK, Chia AY. Синдром хронической усталости связан с хронической энтеровирусной инфекцией желудка. J Clin Pathol. 2007; 61: 43–8.

    Артикул PubMed Google ученый

  • org/ScholarlyArticle»> 20.

    Маес М., Леунис Дж. Нормализация проницаемости кишечника при синдроме хронической усталости (СХУ) сопровождается клиническим улучшением: влияние возраста, продолжительности заболевания и транслокации ЛПС из грамотрицательных бактерий. Neuroendocrinol Lett.2008; 29: 101–9.

    Google ученый

  • 21.

    Maes M, Twisk FN, Kubera M, Ringel K, Leunis JC, Geffard M. Повышенный IgA-ответ на LPS комменсальных бактерий связан с воспалением и активацией клеточного иммунитета при синдроме хронической усталости. J влияет на Disord. 2012; 136: 909–17.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 22.

    Батт Х.Л., Данстан Р.Х., МакГрегор Н.Р., Робертс Т.К., Харрисон Т.Л., Грейнджер-младший. Подавление роста микробов в фекалиях у пациентов с хронической усталостью / болью. В: Материалы Международной клинической и научной конференции AHMF. Сидней, Австралия; 1998.

  • 23.

    Sheedy JR, Wettenhall REH, Ssanlon D, Gooley PR, Lewis DP, McGregor NR, et al. Повышенное содержание d-молочнокислых кишечных бактерий у пациентов с синдромом хронической усталости. In Vivo (Бруклин). 2009; 23: 621–8.

    CAS Google ученый

  • 24.

    Frémont M, Coomans D, Massart S, De Meirleir K. Высокопроизводительное секвенирование гена 16S рРНК выявляет изменения микробиоты кишечника у пациентов с миалгическим энцефаломиелитом / синдромом хронической усталости. Анаэроб. 2013; 22: 50–6.

    Артикул PubMed Google ученый

  • org/ScholarlyArticle»> 25.

    Giloteaux L, Goodrich JK, Walters WA, Levine SM, Ley RE, Hanson MR. Уменьшение разнообразия и изменение состава микробиома кишечника у людей с миалгическим энцефаломиелитом / синдромом хронической усталости.Микробиом. 2016; 4:30.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 26.

    Надь-Сакаль Д., Уильямс Б.Л., Мишра Н., Че Х, Ли Б., Бейтман Л. и др. Метагеномные профили кала в подгруппах пациентов с миалгическим энцефаломиелитом / синдромом хронической усталости. Микробиом. 2017; 5: 44.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 27.

    Джексон М.Л., Батт Х, Болл М., Льюис Д.П., Брук Д. Качество сна и лечение дисбаланса кишечной микробиоты при синдроме хронической усталости: пилотное исследование. Sleep Sci. 2015; 8: 124–33.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 28.

    Уоллис А., Батт Х, Болл М., Льюис Д.П., Брук Д. Поддержка микрогендерома: ассоциации в клинической популяции людей. Sci Rep.2016; 6: 19171.

  • 29.

    Уоллис А., Батт Х, Болл М., Льюис Д. П., Брук Д. Поддержка микрогендерома побуждает исследовать половые различия. Кишечные микробы. 2017; 8: 46–52.

    Артикул PubMed Google ученый

  • 30.

    Крайан Дж.Ф., Динан Т.Г. Микроорганизмы, изменяющие сознание: влияние микробиоты кишечника на мозг и поведение. Nat Rev Neurosci. 2012; 13: 701–12.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • org/ScholarlyArticle»> 31.

    Ри Ш., Поулакис Ц., Майер Э.А. Принципы и клиническое значение оси мозг-кишечник-кишечная микробиота. 2009; 6: 306–14.

    CAS Google ученый

  • 32.

    Mayer EA. Интуиция: зарождающаяся биология коммуникации между кишечником и мозгом. Nat Rev Neurosci. 2011; 12: 453–66.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 33.

    Ohland CL, Jobin C. Микробная активность и гомеостаз кишечника: тонкий баланс между здоровьем и болезнью.Клетка Мол Гастроэнтерол Гепатол. 2015; 1: 28–40.

    Артикул PubMed Google ученый

  • 34.

    Bested AC, Logan AC, Selhub EM. Кишечная микробиота, пробиотики и психическое здоровье: от Мечникова до современных достижений: часть II — современные контекстные исследования. Gut Pathog. 2013; 5: 1–14.

    Артикул Google ученый

  • 35.

    Bailey MT, Coe CL. Материнское разделение нарушает целостность кишечной микрофлоры у детенышей макак-резусов.Dev Psychobiol. 1999; 35: 146–55.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 36.

    Десбонне Л., Гаррет Л., Кларк Дж., Кили Б., Крайан Дж. Ф., Динан Т. Г.. Когнитивная, поведенческая и системная нейробиология: эффекты пробиотика Bifidobacterium infantis в модели депрессии, разделенной матерями. Неврология. 2010; 170: 1179–88.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • org/ScholarlyArticle»> 37.

    О’Махони С.М., Марчези Дж. Р., Скалли П., Кодлинг С., Сеолхо А. М., Куигли EMM и др. Стресс в раннем возрасте изменяет поведение, иммунитет и микробиоту у крыс: последствия для синдрома раздраженного кишечника и психических заболеваний. Биол Психиатрия. 2009; 65: 263–7.

    Артикул PubMed Google ученый

  • 38.

    Sullivan A, Nord CE, Evengård B. Влияние добавки с молочнокислыми бактериями на усталость и физическую активность у пациентов с синдромом хронической усталости.Нутр Дж. 2009; 8 (1): 4.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 39.

    Рао А.В., Бестед А.С., Больн TM, Кацман М.А., Иорио С., Берарди Дж. М. и др. Рандомизированное двойное слепое плацебо-контролируемое пилотное исследование пробиотика при эмоциональных симптомах синдрома хронической усталости. Gut Pathog. 2009; 1: 6.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 40.

    Groeger D, O’Mahony L, Murphy EF, Bourke JF, Dinan TG, Kiely B, et al. Bifidobacterium infantis 35624 модулирует воспалительные процессы хозяина за пределами кишечника. Кишечные микробы. 2013; 4: 325–39.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 41.

    Бороды Т.Дж., Новак А., Финлейсон С. Микробиом ЖКТ и его роль в синдроме хронической усталости: краткое изложение бактериотерапии. J Australas Coll Nutr Environ Med. 2012; 31: 3.

    Google ученый

  • 42.

    Уоллис А., Болл М., Маккечни С., Батт Х, Льюис Д.П., Брук Д. Изучение клинического сходства между миалгическим энцефаломиелитом / синдромом хронической усталости и d-лактоацидозом: систематический обзор. J Transl Med. 2017; 15: 129.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 43.

    Таппенден К.А. Патофизиология синдрома короткой кишки: рассмотрение резецированной и остаточной анатомии.JPEN J Parenter Enteral Nutr. 2014; 38 (1 доп.): 14С – 22С.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 44.

    Petersen C. d-лактоацидоз. Nutr Clin Pract Off Publ Am Soc Parenter Enter Nutr. 2005; 20: 634–45.

    Артикул Google ученый

  • org/ScholarlyArticle»> 45.

    Гоффин П., Дегорэн М., Майнарди Д.Л., Титгат И., Шампомье-Верже М.С., Клееребезем М. и др. Рацемизация лактата как путь спасения для доставки d-лактата в механизм биосинтеза клеточной стенки у Lactobacillus plantarum .J Bacteriol. 2005. 187: 6750–61.

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый

  • 46.

    Flak MB, Neves JF, Blumberg RS. Добро пожаловать на микрогендером. Наука (80-). 2013; 339: 1044–5.

    CAS Статья Google ученый

  • 47.

    Каррутерс Б.М., Джейн А.К., ДеМейрлейр К.Л., Петерсон Д.Л., Климас Н.Г., Лернер А.М. и др. Миалгический энцефаломиелит / синдром хронической усталости: определение клинического рабочего случая, протоколы диагностики и лечения. J Syndr. Хронической усталости. 2003. 11: 7–116.

    Артикул Google ученый

  • 48.

    Управление терапевтическими товарами. Австралийское руководство по клиническим испытаниям: простое практическое руководство по проведению клинических испытаний в соответствии с международными стандартами надлежащей клинической практики (GCP) в контексте Австралии. Правительство Австралии, Министерство здравоохранения и старения; 2006.

  • 49.

    Scheijen JLJM, Hanssen NMJ, Van De Waarenburg MPH, Stehouwer CDA, Schalkwijk CG, Jonkers DMAE.L (+) и D (-) лактат увеличиваются в образцах плазмы и мочи диабета 2 типа, что измеряется одновременным количественным определением L (+) и D (-) лактата с помощью тандемной масс-спектрометрии с обращенно-фазовой жидкостной хроматографией. Exp Diabetes Res. 2012; 2012: 234812.

    Артикул Google ученый

  • 50.

    Армстронг CW, МакГрегор Н.Р., Льюис Д.П., Батт Х.Л., Гули ПР. Метаболическое профилирование выявляет аномальный энергетический метаболизм и пути окислительного стресса у пациентов с синдромом хронической усталости.Метаболомика. 2015; 11: 1626–39.

    CAS Статья Google ученый

  • 51.

    Коулл Дж. Т., Миддлтон ХК, Роббинс Т.В., Саакян Б.Дж. Клонидин и диазепам по-разному влияют на тесты внимания и обучения. Психофармакология. 1995; 120: 322–32.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 52.

    Curran SL, Others A. Краткая форма профиля состояний настроения (POMS-SF): психометрическая информация.Psychol Assess. 1995; 7: 80–3.

    Артикул Google ученый

  • 53.

    Cambridge Cognition. CANTAB [Программное обеспечение для когнитивной оценки]. 2015.

  • 54.

    Buysse DJ, Reynolds CF, Monk TH, Berman SR, Kupfer DJ III, CFR CF и др. Индекс качества сна Питтсбурга: новый инструмент для психиатрической практики и исследований. Psychiatry Res. 1989; 28: 193–213.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 55.

    Ловибонд Ш., Ловибонд ПФ. Пособие по шкалам депрессии, тревожности, стресса. 2-е изд. Сидней: Фонд психологии Австралии; 1995.

    Google ученый

  • 56.

    Сметс Е.М., Гарссен Б., Бонке Б., Де Хаес Дж. Психометрические характеристики многомерного инвентаря утомления (MFI) инструмента для оценки утомляемости. J Psychosom Res. 1995; 39: 315–25.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 57.

    Джейсон Л.А., Джессен Т., Портер Н., Боултон А., Глория-Нджоку М., Фридберг Ф. Изучение типов усталости у людей с ME / CFS. Disabil Stud Q. 2009; 29: 9.

    Google ученый

  • 58.

    IBM Corp. IBM SPSS Statistics для Windows.

  • org/ScholarlyArticle»> 59.

    Moher D, Hopewell S, Schulz KF, Montori V, Gøtzsche PC, Devereaux PJ, et al. CONSORT 2010: объяснение и уточнение: обновленное руководство по отчетности о рандомизированных исследованиях в параллельных группах.Int J Surg. 2012; 10: 28–55.

    Артикул PubMed Google ученый

  • 60.

    Коэн Дж. Статистический анализ мощности для наук о поведении. Хиллсдейл: L. Erlbaum Associates; 1988.

    Google ученый

  • 61.

    Wuensch KL. Использование SPSS для получения доверительного интервала для R-квадрата из регрессии. Северная Каролина: Гринвилл; 2016.

    Google ученый

  • 62.

    Feng C, Wang H, Lu N, Chen T., He H, Lu Y, et al. Лог-преобразование и его значение для анализа данных. Психиатрия Шанхайской арки. 2014; 26: 105–9.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 63.

    Альтман Д.Г. Практическая статистика для медицинских исследований. Лондон: CRS Press Reprint; 1999.

    Google ученый

  • 64.

    Паллант Дж.Ф. Руководство по выживанию SPSS: пошаговое руководство по анализу данных с использованием IBM SPSS.Сидней: Аллен и Анвин; 2016.

    Google ученый

  • 65.

    Табачник Б.Г., Фиделл Л.С. Использование многомерной статистики. 6-е изд. Нью-Джерси: Pearson Education; 2013.

    Google ученый

  • 66.

    Fritz CO, Morris PE, Richler JJ. Оценка размера эффекта: текущее использование, расчеты и интерпретация. J Exp Psychol Gen.2012; 141: 2–18.

    Артикул PubMed Google ученый

  • 67.

    Майер М., Велберг Л.А., Капурон Л., Миллер А.Х., Паньони Г., Ривз В. Нейропсихологические показатели у лиц с синдромом хронической усталости: результаты популяционного исследования. Psychosom Med. 2008. 70: 829–36.

    Артикул PubMed Google ученый

  • 68.

    Армстронг CW, Гули П.Р., МакГрегор Н.Р., Льюис Д.П., Батт Х.Л. Связь фекальной микробиоты и метаболитов фекалий, сыворотки крови и мочи при миалгическом энцефаломиелите / синдроме хронической усталости. Метаболомика. 2017; 13 (1): 8.

    Артикул Google ученый

  • 69.

    Da Poian AT, El-Bacha T, Luz MRMP. Использование питательных веществ в организме человека: пути метаболизма. Nat Educ. 2010; 3: 11.

    Google ученый

  • 70.

    Салазар Н., Геймонд М., Эрнандес-Барранко А.М., Руас-Мадиедо П., Клара Г. Экзополисахариды, продуцируемые кишечными штаммами Bifidobacterium, действуют как ферментируемые субстраты для кишечных бактерий человека.Appl Environ Microbiol. 2008; 74: 4737–45.

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый

  • 71.

    Риос-Ковиан D, Куэста I, Альварес-Буйлла JR, Руас-Мадьедо П. , Геймонд М., де лос Рейес-Гавилан CG. Bacteroides fragilis метаболизирует экзополисахариды, вырабатываемые бифидобактериями. BMC Microbiol. 2016; 16: 150.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 72.

    Барр Д., Уайлдер Л., Каудилл С., Гонсалес А., Нидхэм Л., Пиркл Дж. Концентрации креатинина в моче у населения США: значение для измерений биологического мониторинга мочи. Перспектива здоровья окружающей среды. 2005; 113: 192.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 73.

    Cho HJ, Hotopf M, Wessely S. Ответ на плацебо при лечении синдрома хронической усталости: систематический обзор и метаанализ. Psychosom Med.2005; 67: 301–13.

    Артикул PubMed Google ученый

  • org/ScholarlyArticle»> 74.

    Сведо С.Е., Леонард Х.Л., Гарви М., Миттлман Б., Аллен А.Дж., Перлмуттер С. и др. Педиатрические аутоиммунные психоневрологические расстройства, связанные со стрептококковыми инфекциями: клиническое описание первых 50 случаев. Am J Psychiatry. 1998. 155: 264–71.

    CAS PubMed Google ученый

  • 75.

    Сведо С., Зейдлитц Дж., Ковачевич М., Латимер М., Хоммер Р., Лоуджи Л. и др.Клинические проявления аутоиммунных нейропсихиатрических расстройств у детей, связанных со стрептококковыми инфекциями, в исследованиях и в общественных местах. J Child Adolesc Psychopharmacol. 2015; 25: 26–30.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 76.

    Дейл Р.С., Невилл Б. Г., Годдард Э., Кокс Т.К., Клинг Чонг В.К., Уильямс А. и др. Острый постстрептококковый диссеминированный энцефаломиелит с поражением базальных ганглиев и аутореактивными антителами против базальных ганглиев.Энн Нейрол. 2001; 50: 588–95.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 77.

    Vermeulen RCW, Scholte HR. Азитромицин при синдроме хронической усталости (СХУ), анализ клинических данных. J Transl Med. 2006; 4: 34.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 78.

    Вулф А., Хан Ф. Эритромицин: механизм действия. Наука (80-). 1964; 143: 1445.

    CAS Статья Google ученый

  • org/ScholarlyArticle»> 79.

    Ито З., Накая М., Сузуки Т., Араи Х., Вакабаяси К. Эритромицин имитирует экзогенный мотилин в сократительной активности желудочно-кишечного тракта у собак. Am J Physiol. 1984; 247: G688–94.

    CAS PubMed Google ученый

  • 80.

    Сэнгер Дж. Дж., Брод Дж., Эндрюс ПЛР. Перспектива: взаимосвязь между моторикой желудка и тошнотой: желудочные прокинетические агенты как методы лечения.Eur J Pharmacol. 2013; 715: 10–4.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 81.

    Карри Дж. И., Лендер Т. Д., Стрингер М. Д. Эритромицин как прокинетический агент у младенцев и детей. Алимент Pharmacol Ther. 2001; 15: 595–603.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • org/ScholarlyArticle»> 82.

    Пиментел М., Чоу Э.Дж., Лин Х.С. Ликвидация избыточного бактериального роста в тонком кишечнике снижает симптомы синдрома раздраженного кишечника.Am J Gastroenterol. 2000; 95: 3503–6.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 83.

    Спиллер Р. Обзорная статья: пробиотики и пребиотики при синдроме раздраженного кишечника. Алимент Pharmacol Ther. 2008. 28: 385–96.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 84.

    Bermudez-Brito M, Plaza-Diaz J, Munoz-Quezada S, Gomez-Llorente C, Gil A. Пробиотические механизмы действия.Энн Нутр Метаб. 2012; 61: 160–74.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • org/ScholarlyArticle»> 85.

    Томас С.М., Версалович Дж. Связь между пробиотиками и хозяином: модуляция сигнальных путей в кишечнике. Кишечные микробы. 2010; 1: 148–63.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 86.

    Ван И, Каспер Л.Х. Роль микробиома в расстройствах центральной нервной системы.Иммунное поведение мозга. 2014; 38: 1–12.

    Артикул PubMed Google ученый

  • 87.

    О’Махони С.М., Кларк Дж., Борре Й.Е., Динан Т.Г., Крайан Дж. Ф. Серотонин, метаболизм триптофана и ось мозг-кишечник-микробиом. Behav Brain Res. 2015; 277: 32–48.

    Артикул PubMed Google ученый

  • org/ScholarlyArticle»> 88.

    Зееви Д., Корем Т., Змора Н., Исраэль Д., Ротшильд Д., Вайнбергер А. и др.Персонализированное питание путем прогнозирования гликемических реакций. Клетка. 2015; 163: 1079–94.

    CAS Статья PubMed Google ученый

  • 89.

    Hornig M, Montoya JG, Klimas NG, Levine S, Felsenstein D, Bateman L, et al. Отчетливые иммунные сигнатуры плазмы при ME / CFS присутствуют на ранних стадиях заболевания. Sci Adv. 2015; 1: e1400121.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 90.

    Биллинг-Росс П., Жермен А., Йе К., Кейнан А., Гу З., Хэнсон МР. Варианты митохондриальной ДНК коррелируют с симптомами миалгического энцефаломиелита / синдрома хронической усталости. J Transl Med. 2016; 14:19.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 91.

    Джонстон С., Стейнс Д., Кляйн А., Маршалл-Градисник С. Целевое исследование ассоциации генома, изучающее транзиторные ионные каналы потенциальных рецепторов, рецепторы ацетилхолина и адренергические рецепторы при синдроме хронической усталости / миалгическом энцефаломиелите.BMC Med Genet. 2016; 17: 79.

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 92.

    Schlauch KA, Khaiboullina SF, De Meirleir KL, Rawat S, Petereit J, Rizvanov AA, et al. Полногеномный ассоциативный анализ выявляет генетические вариации у субъектов с миалгическим энцефаломиелитом / синдромом хронической усталости. Перевод Психиатрия. 2016; 6: e730.

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый

  • 93.

    Маркл Дж.Г.М., Франк Д.Н., Мортин-Тот С., Робертсон К.Э., Физел Л.М., Ролл-Кампчик У. и др. Половые различия в микробиоме кишечника определяют гормонозависимую регуляцию аутоиммунитета. Наука (80-). 2013; 339: 1084–8.

    CAS Статья Google ученый

  • 94.

    Lee E, Song E, Nam Y. Дисбиоз микробиома кишечника и его влияние на эпигенетическую регуляцию. J Clin Epigenet. 2017; С1: 14.

    Google ученый

  • 95.

    Гудрич Дж. К., Уотерс Дж. Л., Пул А. С., Саттер Дж. Л., Корен О. , Блехман Р. и др. Человеческая генетика формирует микробиом кишечника. Клетка. 2014; 159: 789–99.

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый

  • Дисбактериоз кишечной палочки коррелирует с желудочно-кишечной дисфункцией у детей с муковисцидозом | Клинические инфекционные болезни

    Аннотация

    Муковисцидоз Желудочно-кишечное заболевание, включающее нарушение всасывания питательных веществ и воспаление кишечника.Мы показываем, что содержание Escherichia coli в фекальной микробиоте было значительно выше у маленьких детей с муковисцидозом, чем в контрольной группе, и коррелировало с фекальными показателями мальабсорбции питательных веществ и воспаления, предполагая, что E. coli может способствовать муковисцидозу желудочно-кишечной дисфункции. .

    Генетическое заболевание кистозный фиброз (CF) вызывается мутациями в регуляторе трансмембранной проводимости CF (CFTR), который регулирует ионную проницаемость эпителиальных клеток и проницаемость для воды. Мутации CFTR приводят к хроническим респираторным инфекциям и дисфункции на поверхности слизистой оболочки желудочно-кишечного тракта (ЖКТ), что приводит к значительной заболеваемости и смертности. Желудочно-кишечный тракт часто является местом самых ранних проявлений CF заболевания, включая тяжелую и рецидивирующую кишечную непроходимость, мальабсорбцию жиров, белков и жирорастворимых витаминов и, как следствие, задержку роста из-за недостаточной секреции ферментов поджелудочной железы [1]. Поскольку ранний рост коррелировал с общей заболеваемостью и смертностью при МВ [1], существует большой интерес к пониманию детерминант успеха и неудачи роста.Появление пероральной терапии ферментами поджелудочной железы и витаминной заместительной терапии улучшило исходы МВ, но сохраняются как ранняя задержка роста, так и кишечная непроходимость [1], что указывает на то, что другие факторы, вероятно, способствуют возникновению этих заболеваний.

    Недавно небольшое количество исследований показало, что микробиота ЖКТ людей с МВ может быть ненормальной [2–4]. Эти исследования были сосредоточены на пожилых людях с МВ, которые получали значительное количество антибиотиков, не имели средств контроля, не относящихся к МВ, и / или использовали технологии, которые либо выявляли только отдельные бактерии (такие как культура или видоспецифическая полимеразная цепная реакция), либо которые не могли различить микробы на уровне видов.Для точного выявления специфической для МВ микробиоты ЖКТ, которая не связана с лечением, в исследовании оптимально сравнивать образцы от очень маленьких детей с МВ и без него с использованием метагеномных инструментов. Есть несколько характеристик, присущих тракту CF GI, которые могут выбрать для измененной микробиоты; к ним относятся ионные и жидкостные аномалии, накопление слизи, мальабсорбция, которая изменяет пул питательных веществ в просвете желудочно-кишечного тракта, и возможные дефекты иммунной функции слизистой оболочки, которые являются результатом дисфункции CFTR.Желудочно-кишечные тракты людей с МВ также часто воспаляются и могут иметь нарушение моторики [1]. Все эти свойства могут привести к микробиоте ЖКТ, специфичной для CF, которая, в свою очередь, может еще больше изменить последующую переработку питательных веществ, воспаление и иммунитет слизистой оболочки, что потенциально может привести к неблагоприятным долгосрочным последствиям для здоровья.

    Мы собрали образцы кала у маленьких детей с МВ и недостаточностью поджелудочной железы в возрасте от нескольких недель до 5 лет, а также у здоровых детей того же возраста без МВ, и проанализировали их микробиоту в качестве первого шага в проверке этой гипотезы.Демографическая информация представлена ​​в дополнительной таблице 1. Используя метагеномный филогенетический анализ (MetaPhlAn [5]) метагеномных последовательностей дробовика, созданных с помощью платформы Illumina HiSeq, мы сравнили микробиоту в этих образцах среди детей с МВ и без него.

    МЕТОДЫ

    Методологические подробности включены в дополнительные данные онлайн. Это исследование было одобрено Наблюдательным советом детской больницы Сиэтла; информированное согласие было получено для всех испытуемых.

    РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

    Мы проанализировали 44 образца от 12 детей с МВ и 39 образцов от 12 детей без МВ. Поразительная разница в составе микробиоты была сразу очевидна во время сравнительного филогенетического анализа образцов фекалий CF и не CF (дополнительная таблица 2). Как показано на Рисунке 1, грамотрицательные бактерии Escherichia coli были заметно более многочисленны в образцах от детей с МВ, чем у детей без МВ.

    Рис. 1.

    A , график в виде прямоугольников относительной численности Escherichia coli во всех образцах фекалий маленьких детей в исследовании с муковисцидозом (CF) и без него, что показывает заметно более высокое содержание E. coli в образцах фекалий пациентов с МВ. Escherichia coli численности в других популяциях без МВ из опубликованных и архивных данных включены для сравнения, включая 139 образцов взрослых особей из проекта Human Microbiome Project (http: // www. hmpdacc.org/) и 94 образца из многонационального исследования микробиома здоровых детей и взрослых [7], разделенных на младенцев (в возрасте ≤ 1 года), детей (в возрасте 1–3 лет) и взрослых (в возрасте> 3 лет). MetaPhlAn (см. Методы) использовался для анализа всех образцов. Подобные результаты были получены при пиросеквенировании гена рибосомной РНК 16S (корреляция Спирмена = 0,896, P <0,001). Относительное содержание E. coli для образцов CF значительно отличалось от значений, полученных для всех показанных анализов без CF ( P <.01). B , Временная картина изобилия E. coli в образцах фекалий детей с (красный) и без (синий) CF. Относительная численность нанесена на график по возрасту объекта-источника; 2 образца от ребенка старше 3 лет, для которых не было контрольных образцов сравнения, опущены для ясности. Показаны номера субъектов для детей с МВ. Жирные линии показывают среднюю относительную численность E. coli для всех образцов CF (красный) по сравнению со всеми образцами без CF (синий) в течение года (т. Е. Возраст от 0 до 365 дней, от 366 до 730 дней и т. Д.) , при этом каждое среднее значение наносится в среднюю точку для каждого года.Красные звездочки обозначают те образцы от субъектов с МВ, которые были собраны в течение 30 дней после лечения антибиотиками; 2 пациента с МВ (113 и 114) никогда не получали никаких антибиотиков в течение их жизни. Сокращения: МВ — муковисцидоз; HMP, Проект человеческого микробиома; MN, многонациональная.

    Рисунок 1.

    Диаграмма , прямоугольная диаграмма относительной численности Escherichia coli во всех образцах фекалий маленьких детей в исследовании с кистозным фиброзом (CF) и без него, выявляя заметно более высокое содержание Э.coli в образцах фекалий субъектов с МВ. Escherichia coli численности в других популяциях, не страдающих МВ, из опубликованных и архивных данных включены для сравнения, включая 139 взрослых образцов из проекта Human Microbiome Project (http://www.hmpdacc.org/) и 94 образца из международного исследования микробиома здоровых детей и взрослых [7], разделенных на младенцев (в возрасте ≤ 1 года), детей (в возрасте 1-3 лет) и взрослых (в возрасте> 3 лет). MetaPhlAn (см. Методы) использовался для анализа всех образцов.Подобные результаты были получены при пиросеквенировании гена рибосомной РНК 16S (корреляция Спирмена = 0,896, P <0,001). Относительное содержание E. coli для образцов CF значительно отличалось от значений, полученных для всех показанных не-CF анализов ( P <0,01). B , Временная картина изобилия E. coli в образцах фекалий детей с (красный) и без (синий) CF. Относительная численность нанесена на график по возрасту объекта-источника; 2 образца от ребенка старше 3 лет, для которых не было контрольных образцов сравнения, опущены для ясности.Показаны номера субъектов для детей с МВ. Жирные линии показывают среднюю относительную численность E. coli для всех образцов CF (красный) по сравнению со всеми образцами без CF (синий) в течение года (т. Е. Возраст от 0 до 365 дней, от 366 до 730 дней и т. Д.) , при этом каждое среднее значение наносится в среднюю точку для каждого года. Красные звездочки обозначают те образцы от субъектов с МВ, которые были собраны в течение 30 дней после лечения антибиотиками; 2 пациента с МВ (113 и 114) никогда не получали никаких антибиотиков в течение их жизни.Сокращения: МВ — муковисцидоз; HMP, Проект человеческого микробиома; MN, многонациональная.

    Escherichia coli обычно содержит <5% бактериальных клеток в образцах фекалий человека примерно к 1 месяцу возраста, обычно снижается до <1% и остается в таком виде в дальнейшем [6]. Соответственно, численность E. coli была значительно выше, чем сообщалось в предыдущих исследованиях микробиоты в педиатрической популяции (рис. 1) [7]. Относительно высокая численность E.coli в толстом кишечнике были связаны с воспалением и канцерогенезом желудочно-кишечного тракта при воспалительном заболевании кишечника [8], функционально связывая дисбиоз, при котором этот вид преобладает, с заболеванием желудочно-кишечного тракта.

    Многомерная модель смешанного эффекта, учитывающая повторные измерения, была использована для оценки того, коррелирует ли численность E. coli с клиническими характеристиками. Поскольку лечение антибиотиками также было связано с временным повышением уровня E.coli в желудочно-кишечном тракте, и поскольку фекальная микробиота детей, получавших антибиотики, в основном возвращается к конфигурации до лечения в течение 15 дней [9], 12 образцов, взятых в течение 30 дней лечения антибиотиками (все они были взяты у 7 субъектов с МВ, Дополнительные таблицы 1 и 4) были исключены для этого анализа. Из переменных, включенных в модель (CF, возраст, кормление грудью или смесью, столовая диета, уровни воспалительного маркера кальпротектина и содержание жира в кале), кальпротектин и фракционное количество жира в стуле независимо друг от друга значимо коррелировали с Э.coli (обе P <0,02; дополнительная таблица 3). В то время как МВ был связан с численностью E. coli в однофакторной модели ( P <.0001), эта связь была потеряна после поправки на фекальный жир и кальпротектин из-за их сильной связи с МВ.

    Хроническая респираторная инфекция у детей с МВ часто проявляется в клональной экспансии отдельных линий конкретных видов бактерий в легких. Чтобы определить, действительно ли E.coli фекальные популяции у детей с МВ были аналогичным образом клональными, мы выполнили анализ компьютерного мультилокусного типирования последовательностей (MLST) с использованием считывания метагеномных данных дробовика для 8 образцов CF и 10 образцов без CF (каждый образец от другого субъекта), которые сопоставлены с 7 генов «домашнего хозяйства» E. coli в схеме MLST. Этот анализ показал, что, в отличие от респираторных инфекций, популяции кишечника , кишечника и не муковисцидозов, E. coli обычно состояли из отдельных или нескольких параллельных линий.Кроме того, анализ содержания гена E. coli на основе метагеномных данных не продемонстрировал каких-либо уникальных связанных с вирулентностью свойств, таких как обогащение специфическими адгезинами или другими генами вирулентности, в популяциях CF и не-CF. Таким образом, хотя E. coli было больше в образцах фекалий CF, не было никаких уникальных эпидемиологических особенностей популяций CF GI E. coli , позволяющих предположить специфические патогенные характеристики у этих организмов, по крайней мере, на этой ранней стадии заболевания.

    Предыдущие качественные исследования фекальной микробиоты МВ выявили дисбиозы, характеризующиеся относительно редкой представленностью рода Bifidobacterium [2–4] и более низким общим разнообразием [3] по сравнению с образцами, взятыми у людей без МВ. Тем не менее, испытуемые в этих исследованиях, как правило, были намного старше младенцев, что привело авторов к предположению, что эти различия были вызваны высоким бременем антибиотиков, которым подвергались их испытуемые. В двух недавних исследованиях фекальной микробиоты младенцев [10], детей старшего возраста и взрослых [4] с МВ также было обнаружено большое количество бактериальных таксонов, идентифицированных как Escherichia , хотя их количественная оценка не определена; сравнение с образцами без CF не проводилось; и не было представлено анализов взаимосвязи с диетой, лечением (включая антибиотики), фекальным жиром или показателями воспаления. Напротив, фокус этого исследования на маленьких детях, корреляция с мальабсорбцией и воспалением, а также исключение из статистического анализа образцов, собранных после недавнего лечения антибиотиками, указывают на то, что наблюдаемый дисбактериоз является результатом характеристик самого просвета желудочно-кишечного тракта CF, а не чем терапия или диета. Однако эти результаты не определили, был ли дисбактериоз E. coli , показанный здесь у маленьких детей с МВ, прямым результатом дисфункции МВТР, общего свойства, связанного с мальабсорбцией и воспалением в желудочно-кишечном тракте, или и тем, и другим.

    Корреляция с содержанием жира в фекалиях может отражать выбор питания для E. coli , который может метаболизировать белок или липиды, которые плохо всасываются и поэтому присутствуют в большом количестве в желудочно-кишечном тракте CF [1]. В качестве альтернативы, поскольку содержание фекального жира частично служит маркером дисфункции CFTR желудочно-кишечного тракта, связь с численностью E. coli на самом деле может быть связана с другими дисфункциональными особенностями, характерными для желудочно-кишечного тракта , , такими как снижение подвижности или слизи. накопление [1] Главный источник питательных веществ для E.coli в здоровом желудочно-кишечном тракте является сахаром, связанным со слизью [11], поэтому скопившаяся слизь может привести к увеличению популяции E. coli , метаболизирующей слизь.

    Более высокие показатели калпротектина в кале, свидетельствующие о воспалении ЖКТ, наблюдаемые у детей с МВ в этом исследовании, согласуются с результатами предыдущих исследований [1]. Возникает соблазн задуматься о том, является ли наблюдаемая более высокая численность E. coli источником или продуктом воспаления ЖКТ.Повышенное содержание E. coli (но не такое поразительное, как в этом исследовании) наблюдалось среди людей с различными воспалительными заболеваниями кишечника [8]. Коллективные данные этих и других исследований предполагают, что изменения, происходящие в просвете кишечника во время воспаления, могут как увеличивать способность E. coli колонизировать слизистую оболочку кишечника, так и дополнительно вызывать воспаление [12]. Поскольку популяция E. coli могла увеличиться в желудочно-кишечном тракте детей с МВ из-за их способности использовать более высокие уровни присутствующего жира и слизи, E.coli может служить как маркером, так и причиной дисфункции и заболевания ЖКТ при МВ.

    Независимо от механизма, высокое содержание в фекалиях E. coli может способствовать воспалению желудочно-кишечного тракта [8], изменять метаболизм и абсорбцию липидов [13] и усугублять заболевание ЖКТ и недоедание. Таким образом, ранние измерения дисбактериоза E. coli могут предсказать тяжелое заболевание ЖКТ, последующий плохой рост и связанные с этим клинические исходы МВ. Идентификация E. coli дисбактериоза у этих маленьких детей, таким образом, может предоставить возможность вмешательства и улучшения результатов для людей с МВ посредством терапевтических манипуляций с их микробиотой ЖКТ. Это предварительное исследование подчеркивает необходимость дополнительных исследований для определения содержания E. coli в фекальной микробиоте большей популяции детей с МВ, изменений этой микробиоты с возрастом детей, причин наблюдаемого дисбиоза и его влияния на ранние клинические исходы МВ.

    Банкноты

    Финансовая поддержка. Эта работа была поддержана Национальными институтами здравоохранения (номера грантов P30 DK089507 и K02 HL105543).

    Возможный конфликт интересов. Все авторы: о конфликтах не сообщалось.

    Все авторы отправили ICMJE Форму раскрытия информации о потенциальных конфликтах интересов. Выявлены конфликты, которые редакция считает относящимися к содержанию рукописи.

    Список литературы

    1,.

    Муковисцидоз кишечника

    ,

    Cold Spring Harb Perspect Med

    ,

    2013

    , vol.

    3

    стр.

    a009753

    2,,,,,.

    Дисбиоз бифидобактерий и Clostridium кластер XIVa в фекальной микробиоте при муковисцидозе

    ,

    J Cyst Fibros

    ,

    2013

    , т.

    12

    (стр.

    206

    15

    ) 3,,,,,.

    Дисбактериоз кишечника при муковисцидозе

    ,

    J Cyst Fibros

    ,

    2012

    , т.

    11

    (стр.

    454

    5

    ) 4« и др.

    Аллельные варианты регулятора трансмембранной проводимости при муковисцидозе (CFTR) связаны со сдвигами в фекальной микробиоте пациентов с муковисцидозом

    ,

    PLoS One

    ,

    2013

    , vol.

    8

    стр.

    e61176

    5,,,,,.

    Метагеномное профилирование микробного сообщества с использованием уникальных маркерных генов, специфичных для клады

    ,

    Nat Methods

    ,

    2012

    , vol.

    9

    (стр.

    811

    4

    ) 6,.

    Установление микробиоты кишечника у западных младенцев

    ,

    Acta Paediatr

    ,

    2009

    , vol.

    98

    (стр.

    229

    38

    ) 7« и др.

    Микробиом кишечника человека в разрезе возраста и географии

    ,

    Nature

    ,

    2012

    , vol.

    486

    (стр.

    222

    7

    ) 8« и др.

    Воспаление кишечника направлено против канцерогенной активности микробиоты

    ,

    Science

    ,

    2012

    , vol.

    338

    (стр.

    120

    3

    ) 9,,,,,.

    Микробиота фекалий грудных детей после антибиотикотерапии

    ,

    Acta Paediatr

    ,

    2011

    , vol.

    100

    (стр.

    75

    8

    ) 10,,, et al.

    Серийный анализ микробиома кишечника и дыхательных путей при муковисцидозе в младенчестве: взаимодействие между кишечником и дыхательными путями и влияние пищевых факторов

    ,

    MBio

    ,

    2012

    , vol.

    3

    (стр.

    e00251

    12

    ) 11« и др.

    Углеродное питание Escherichia coli в кишечнике мыши

    ,

    Proc Natl Acad Sci U S A

    ,

    2004

    , vol.

    101

    (стр.

    7427

    32

    ) 12« и др.

    Западная диета вызывает дисбиоз с увеличением E coli у мышей CEABAC10, изменяет барьерную функцию хозяина, способствуя колонизации AIEC

    ,

    Gut

    ,

    2013

    13,,, et al.

    Микробиота регулирует кишечную абсорбцию и метаболизм жирных кислот у рыбок данио

    ,

    Cell Host Microbe

    ,

    2012

    , vol.

    12

    (стр.

    277

    88

    ) © Автор, 2013 г. Опубликовано издательством Oxford University Press от имени Общества инфекционистов Америки. Все права защищены. Для получения разрешений обращайтесь по электронной почте: [email protected].

    (PDF) Микробный дисбиоз тонкого кишечника лежит в основе симптомов, связанных с функциональными желудочно-кишечными расстройствами.

    К образцам была применена нормализация вероятностного коэффициента

    .Собственные скрипты

    были использованы для построения моделей PCA и OPLS-DA и интеграции интересующих пиков.

    Корреляции и тенденции характеристик были проанализированы в R.

    Сводка отчетов. Дополнительную информацию о дизайне исследования можно найти в

    Резюме отчета по исследованию природы, связанном с этой статьей.

    Доступность данных

    Все данные ампликонов гена 16 S рРНК и связанные с ними метаданные, которые подтверждают результаты

    этого исследования, доступны в Европейском архиве нуклеотидов с кодами доступа

    PRJEB31438 и PRJEB31439.Данные метаболомики доступны через базу данных EMBL-EBI

    MetaboLights с кодом доступа MTBLS876, данные RNAseq доступны в базе данных

    GEO под номером доступа GSE128189.

    Доступность кода

    Ранее опубликованные программные пакеты и версии, используемые для анализа микробиома,

    метаболомики и данных RNAseq, цитируются в приведенных выше методах. Код R, используемый для биоинформатической обработки данных микробиома

    и построения симптоматических

    и индексов дисбактериоза, доступен на GitHub (https: // github.ru / RRShieldsCutler /

    small_bowel_dysbiosis /).

    Получено: 4 октября 2018 г. Принято: 3 апреля 2019 г.

    Список литературы

    1. Simren, M. et al. Кишечная микробиота при функциональных расстройствах кишечника: отчет фонда Rome

    . Gut 62, 159–176 (2013).

    2. Бхаттарай Ю., Мунис Педрого Д. А. и Кашьяп П. С. Раздраженный кишечник

    Синдром

    : расстройство, связанное с кишечной микробиотой? Являюсь. J. Physiol. Гастроинтест.

    Liver Physiol. 312, G52 – G62 (2017).

    3. Костич, А. Д., Ксавьер, Р. Дж. И Геверс, Д. Микробиом при воспалительном заболевании

    кишечника: текущее состояние и будущее. Гастроэнтерология 146,

    1489–1499 (2014).

    4. Эль Эйди, С., Ван ден Богерт, Б. и Клеребезем, М. Тонкая кишка

    микробиота, модуляция питания и значение для здоровья. Curr. Мнение.

    Biotechnol. 32,14–20 (2015).

    5. Chung, C. S. et al. Различия микробиоты тонкой кишки и фекалий между

    пациентами с синдромом раздраженного кишечника и здоровыми людьми.Сканд. J. Gastroenterol.

    51, 410–419 (2016).

    6. Dlugosz, A. et al. Нет разницы в микробиоте тонкой кишки между пациентами

    с синдромом раздраженного кишечника и здоровыми людьми. Sci. Отчет 5, 8508 (2015).

    7. Booijink, C.C. et al. Высокие временные и межиндивидуальные вариации обнаружены в

    микробиоте подвздошной кишки человека. Environ. Microbiol 12, 3213–3227 (2010).

    8. Zoetendal, E. G. et al. Микробиота тонкой кишки человека определяется быстрым поглощением и преобразованием

    простых углеводов.ISME J. 6, 1415–1426 (2012).

    9. Quigley, E. M. et al. Подвижность терминального отдела подвздошной кишки и илеоцекального сфинктера у

    здоровых людей. Гастроэнтерология 87, 857–866 (1984).

    10. Weems, W. A. ​​Кишечник как движущая сила жидкости. Annu Rev. Physiol.

    43,9–19 (1981).

    11. Nguyen, H. N. et al. Аномальный постпрандиальный перенос химуса двенадцатиперстной кишки у

    пациентов с длительным инсулинозависимым сахарным диабетом. Gut 41,

    624–631 (1997).

    12. Corazza, G. R. et al. Диагноз избыточного бактериального роста в тонкой кишке.

    Надежность посева тощей кишки и несоответствие водородного анализа дыхания.

    Гастроэнтерология 98, 302–309 (1990).

    13. Кинг, К. Э. и Тоскес, П. П. Сравнение 1-граммовой [14C] ксилозы, 10-граммовой

    лактулозы-h3 и 80-граммовой глюкозы-h3 дыхательных тестов у пациентов с избыточным бактериальным ростом тонкой кишки

    . Гастроэнтерология 91, 1447–1451 (1986).

    14.Bauer, T. M. et al. Диагностика избыточного бактериального роста в тонкой кишке у

    пациентов с циррозом печени: плохие показатели глюкозного дыхания

    водородный тест. J. Hepatol. 33, 382–386 (2000).

    15. Кинг, К. Э. и Тоскес, П. П. Разрастание бактерий в тонком кишечнике.

    Гастроэнтерология 76, 1035–1055 (1979).

    16. Hamilton, J. D. et al. Оценка и значимость избыточного бактериального роста

    тонкой кишки. Q. J. Med. 1970. Т. 39. С. 265–285.

    17. Табакчали С., Окубадеджо О. А., Нил Г. и Бут К. С. Влияние

    аномальной бактериальной флоры на функцию тонкого кишечника. Proc. R. Soc. Med 59,

    1244–1246 (1966).

    18. Максвелл, П. Р., Ринк, Э., Кумар, Д. и Мендалл, М. А. Антибиотики усиливают

    функциональных абдоминальных симптома. Являюсь. J. Gastroenterol. 97, 104–108 (2002).

    19. Гошал, Калифорния, Сривастава, Д., Мисра, А. и Гошал, У. Подтвержденное исследование

    , показывающее, что антибиотики более эффективны при синдроме раздраженного кишечника

    с тонкой кишкой чрезмерный рост: рандомизированное двойное слепое плацебо-контролируемое исследование

    .Евро. J. Gastroenterol. Гепатол. 28,

    281–289 (2016).

    20. Bures, J. et al. Синдром избыточного бактериального роста в тонком кишечнике. World J.

    Гастроэнтерол. 16, 2978–2990 (2010).

    21. Кардинг, С., Вербеке, К., Випонд, Д. Т., Корф, Б. М. и Оуэн, Л. Дж. Дисбиоз

    микробиоты кишечника при заболевании. Микро. Ecol. Health Dis. 26, 26191 (2015).

    22. Яцуненко Т. и др. Микробиом кишечника человека в зависимости от возраста и географии

    .Природа 486, 222–227 (2012).

    23. Moayyedi, P. et al. Влияние пищевых добавок на синдром раздраженного кишечника

    : систематический обзор и метаанализ. Являюсь. J. Gastroenterol. 109,

    1367–1374 (2014).

    24. Montassier, E. et al. CLOUD: непараметрический тест на обнаружение выбросов

    микробиома. Микробиом 6, 137 (2018).

    25. Grover, M. et al. Избыточный бактериальный рост тонкого кишечника при раздраженном кишечнике

    синдром: связь с перистальтикой толстой кишки, симптомами кишечника и

    психологическим стрессом.Нейрогастроэнтерол. Мотил. 20. С. 998–1008 (2008).

    26. Форд, А. К., Шпигель, Б. М., Талли, Н. Дж. И Моайеди, П. Тонкий кишечник

    Избыточный бактериальный рост при синдроме раздраженного кишечника: систематический обзор и мета-

    анализ. Clin. Гастроэнтерол. Гепатол. 7. С. 1279–1286 (2009).

    27. Уолтерс, Б. и Ваннер, С. Дж. Обнаружение избыточного бактериального роста при СРК с использованием дыхательного теста

    лактулозы h3: сравнение с 14C-D-ксилозой и здоровыми контролями.

    Am.J. Gastroenterol. 100, 1566–1570 (2005).

    28. Tsai, K. et al. Окислительный стресс: важное явление, имеющее патогенетическое значение

    для прогрессирования острого панкреатита. Gut 42, 850–855 (1998).

    29. Banhegyi, G., Braun, L., Csala, M., Puskas, F. & Mandl, J. Ascorbate

    метаболизм и его регуляция у животных. Свободный Радич. Биол. Med. 23, 793–803

    (1997).

    30. Sajjad, A. et al. Ципрофлоксацин подавляет избыточный бактериальный рост, увеличивает инсулин натощак на

    , но не корректирует низкую концентрацию ацилированного грелина при не-

    алкогольном стеатогепатите.Алимент. Pharm. Ther. 22, 291–299 (2005).

    31. Зонненбург, Э. Д. и Зонненбург, Дж. Л. Голодание нашего микробного «я»:

    пагубные последствия диеты, не содержащей доступных для микробиоты

    углеводов. Cell Metab. 20. С. 779–786 (2014).

    32. Peng, L., Li, ZR, Green, RS, Holzman, IR & Lin, J. Бутират усиливает кишечный барьер

    , облегчая сборку плотных контактов посредством активации AMP-

    протеинкиназы в Caco- 2 клеточных монослоя. J. Nutr. 139, 1619–1625

    (2009).

    33. Fukuda, S. et al. Бифидобактерии могут защитить от энтеропатогенной инфекции

    за счет производства ацетата. Nature 469, 543–547 (2011).

    34. Gohl, D. M. et al. Систематическое совершенствование методов определения генов-маркеров ампликонов

    для повышения точности исследований микробиома. Nat. Biotechnol. 34, 942–949

    (2016).

    35. Аль-Галит, Г. А., Хиллманн, Б., Анг, К., Шилдс-Катлер, Р. и Найтс, Д.

    SHI7 — это самообучающийся конвейер для многоцелевого краткосрочного контроля качества ДНК

    . mSystems 3, https: //doi.org/10.1128/mSystems.00202-17 (2018).

    36. Аль-Галит, Г. А. и Найт, Р. BURST обеспечивают оптимальное полное выравнивание ДНК

    для больших данных. Github, https://doi.org/10.5281 (2017).

    37. Needleman, S. B. и Wunsch, C. D. Общий метод, применимый к поиску

    на предмет сходства в аминокислотной последовательности двух белков.J. Mol. Биол. 48,

    443–453 (1970).

    38. Caporaso, J. G. et al. QIIME позволяет анализировать данные секвенирования сообщества с высокой пропускной способностью

    . Nat. Методы 7. 2010. С. 335–336.

    39. Chen, L. et al. GMPR: надежный метод нормализации для данных счетчика

    с нулевым вводом с приложением к данным секвенирования микробиома. PeerJ 6, e4600

    (2018).

    40. Курса, М. Б. и Рудницки, В. Р. Выбор функций с помощью пакета Boruta.

    Дж.Стат. Софтв. https://doi.org/10.18637/jss.v036.i11 (2010).

    41. Карацоглу А., Смола А., Хорник К. и Зейлис А. kernlab — Пакет S4

    для ядерных методов в R. J. Stat. Софтв. https://doi.org/10.18637/jss.v011.i09

    (2004).

    42. Langille, M. G. et al. Прогнозирующее функциональное профилирование микробных сообществ

    с использованием последовательностей гена маркера 16S рРНК. Nat. Biotechnol. 31, 814–821 (2013).

    43. Segata, N. et al. Открытие и объяснение метагеномных биомаркеров. Геном

    Биол. 12, R60 (2011).

    44. Mattiello, F. et al. Веб-приложение для расчета размера выборки и мощности в исследованиях микробиома

    случай-контроль. Биоинформатика 32, 2038–2040 (2016).

    45. Peters, S.A. et al. Женщины с синдромом раздраженного кишечника с преобладанием запора

    обладают нормальным кишечным барьером и секреторной функцией. Являюсь. J. Gastroenterol. 112,

    913–923 (2017).

    46. Kalari, K. R. et al. MAP-RSeq: конвейер анализа Мэйо для секвенирования РНК.

    BMC Bioinformatics 15, 224 (2014).

    47. Трапнелл К., Пахтер Л. и Зальцберг С. Л. TopHat: обнаружение сплайсинговых соединений

    с помощью RNA-Seq. Биоинформатика 25, 1105–1111 (2009).

    48. Андерс, С., Пил, П. Т. и Хубер, В. HTSeq — среда Python для работы с данными высокопроизводительного секвенирования

    . Биоинформатика 31, 166–169 (2015).

    49. Хансен, К. Д., Иризарри, Р. А. и Ву, З. Устранение технической изменчивости в данных

    RNA-seq с использованием условной квантильной нормализации. Биостатистика 13,

    204–216 (2012).

    СТАТЬЯ ПРИРОДА СВЯЗИ | https://doi.org/10.1038/s41467-019-09964-7

    10 СВЯЗЬ С ПРИРОДОЙ | (2019) 10: 2012 | https://doi.org/10.1038 / s41467-019-09964-7 | www.nature.com/naturecommunications

    Информация предоставлена ​​Springer Nature, применяются условия использования. Права защищены

    Отсутствие NLRP3-инфламмасомы приводит к нарушению оси кишечник-печень, дисбактериозу кишечника и ухудшению фенотипа на мышиной модели НАЖБП

    % PDF-1.4 % 1 0 obj > endobj 2 0 obj > поток application / pdfdoi: 10.1038 / s41598-017-11744-6

  • Springer US
  • Научные отчеты, DOI: 10.1038 / s41598-017-11744-6
  • Отсутствие NLRP3-инфламмасомы приводит к нарушению оси кишечник-печень, дисбактериозу кишечника и ухудшению фенотипа на мышиной модели НАЖБП
  • Ирен Пьерантонелли
  • Кьяра Рихлицки
  • Лаура Агостинелли
  • Дебора Мария Джордано
  • Мелания Гаггини
  • Кристина Фраумен
  • Кьяра Сапонаро
  • Валерия Мангина
  • Лорис Сартини
  • Элеонора Мингарелли
  • Клаудио Пинто
  • Эмма Баззиголи
  • Лучано Троцци
  • Антонио Джордано
  • Марко Марциони
  • Samuele De Minicis
  • Серджио Уззау
  • Saverio Cinti
  • Амалия Гастальделли
  • Джанлука Свеглиати-Барони
  • 10. 1038 / s41598-017-11744-6 http://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-11744-6journal Научные отчеты © 2017, Автор (ы) 2045-232210.1038 / s41598-017-11744-6Springer2018-04- 09T11: 23: 48 + 02: 002018-04-06T19: 44: 49 + 05: 302018-04-09T11: 23: 48 + 02: 00TrueiText® 5.3.5 © 2000-2012 1T3XT BVBA (версия AGPL) VoRuuid: 3a5ab41b-263e-4cb9-91a6-acc82515b1d9uuid: 78b67627-9ab3-4ffb-bef1-edea53b20dc3default1
  • converteduuid: 4fa51721-d5d7-413f-939a-55b8a52087-06o: Amp; 2B
  • http: // ns.adobe.com/xap/1.0/mm/xmpMMXMP Media Management Schema
  • внутренний идентификатор на основе UUID для конкретного воплощения документа InstanceIDURI
  • внутренний Общий идентификатор для всех версий и представлений документа. Оригинал Документ IDURI
  • http://ns.adobe.com/pdf/1.3/pdfAdobe PDF Schema
  • internal Объект имени, указывающий, был ли документ изменен для включения информации о треппинге TrappedText
  • http: // ns. adobe.com/pdfx/1.3/pdfxpdfx
  • внутренний идентификатор стандарта PDF / X GTS_PDFXVersionText
  • внутренний Уровень соответствия стандарту PDF / X GTS_PDFXConformanceText
  • внутренний Компания, создающая PDF-файлCompanyText
  • internal Дата последнего изменения документа SourceModifiedText
  • InternalMirror crossmark: DOIdoiText
  • http: // www.aiim.org/pdfa/ns/id/pdfaidPDF/A ID Schema
  • internalPart of PDF / A standardpartInteger
  • внутренний Поправка к стандарту PDF / AamdText
  • внутренний Уровень соответствия стандарту PDF / A Текст
  • http://prismstandard. org/namespaces/basic/2.0/prismPrism
  • external Тип агрегации указывает единицу агрегации для коллекции контента. Комментарий PRISM рекомендует использовать словарь с контролируемым типом агрегирования PRISM для предоставления значений для этого элемента.Примечание: PRISM не рекомендует использовать значение #other, разрешенное в настоящее время в этом контролируемом словаре. Вместо использования #other обратитесь к группе PRISM по адресу [email protected], чтобы запросить добавление вашего термина в словарь с контролируемым типом агрегирования. aggregationTypeText
  • externalCopyright copyrightText
  • external Идентификатор цифрового объекта для статьи. DOI также может использоваться как идентификатор dc :.Если используется в качестве идентификатора dc: identifier, форма URI должна быть захвачена, а пустой идентификатор также должен быть захвачен с помощью prism: doi. Если в качестве требуемого идентификатора dc: identifier используется альтернативный уникальный идентификатор, то DOI должен быть указан как чистый идентификатор только в пределах prism: doi. Если URL-адрес, связанный с DOI, должен быть указан, тогда prism: url может использоваться в сочетании с prism: doi для предоставления конечной точки службы (то есть URL-адреса). doiText
  • externalISSN для электронной версии выпуска, в котором встречается ресурс.Разрешает издателям включать второй ISSN, идентифицирующий электронную версию проблемы, в которой возникает ресурс (следовательно, e (lectronic) Issn. Если используется, prism: eIssn ДОЛЖЕН содержать ISSN электронной версии. См. Prism: issn. issnText
  • external Название журнала или другого издания, в котором был / будет опубликован ресурс. Обычно это будет использоваться для предоставления названия журнала, в котором появилась статья, в качестве метаданных для статьи, наряду с такой информацией, как название статьи, издатель, том, номер и дата обложки. Примечание. Название публикации можно использовать, чтобы различать печатный журнал и онлайн-версию, если названия разные, например, «журнал» и «magazine.com». PublicationNameText
  • externalЭтот элемент предоставляет URL-адрес статьи или единицы контента. Платформа атрибутов необязательно разрешена для ситуаций, в которых необходимо указать несколько URL-адресов. PRISM рекомендует использовать вместе с этим элементом подмножество значений платформы PCV, а именно «мобильный» и «Интернет».ПРИМЕЧАНИЕ. PRISM не рекомендует использовать значение #other, разрешенное в управляемом словаре платформы PRISM. Вместо использования #other обратитесь к группе PRISM по адресу [email protected], чтобы запросить добавление вашего термина в словарь, контролируемый платформой. urlText
  • http://www.niso.org/schemas/jav/1.0/javNISO
  • external Значения для версии статьи журнала могут быть одним из следующих: AO = Авторский оригинал SMUR = Представленная рукопись на рассмотрении AM = принятая рукопись P = Доказательство VoR = Версия записи CVoR = Исправленная версия записи EVoR = Расширенная версия Recordjournal_article_versionClosed Выбор текста
  • конечный поток endobj 3 0 obj > endobj 8 0 объект [9 0 R 10 0 R 11 0 R 12 0 R 13 0 R 14 0 R 15 0 R 16 0 R 17 0 R 18 0 R 19 0 R 20 0 R 21 0 R 22 0 R 23 0 R 24 0 R 25 0 R 26 0 R 27 0 R 28 0 R 29 0 R 30 0 R 31 0 R 32 0 R 33 0 R 34 0 R 35 0 R 36 0 R 37 0 R 38 0 R 39 0 R 40 0 ​​R 41 0 R 42 0 R 43 0 R 44 0 R 45 0 R 46 0 R] endobj 9 0 объект

    .

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *